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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003864`

染色体: Chr02 坐标: 60604629-60606214 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003864`
名称	SmilChr02G003864
描述	WUSCHEL-related homeobox 4-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	60604629 - 60606214 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010806`
GeneID	`131010806`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010806`
原始查询	`SmilChr02G003864`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WUSCHEL-related homeobox 4-like
产物	WUSCHEL-related homeobox 4-like
Arabidopsis	`AT1G46480` (WOX4) WUSCHEL related homeobox 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841113] identity=50; qcov=1.2; evalue=1.39e-63; confidence=high
Rice	`Os04g0649400` (WOX4) - identity=45.6; qcov=0.981; evalue=2.31e-48; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0010067 (procambium histogenesis); GO:0010087 (phloem or xylem histogenesis); GO:0051301 (cell division)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010806

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794448.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794448.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794448.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794448.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794448.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:60605556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:60605586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr2:60605664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B50,C23
`Chr2:60605715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C62
`Chr2:60605742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C44
`Chr2:60605796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr2:60605805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr2:60605832`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B107,B125,B140,B15,B28,B76,B99,C62,D9
`Chr2:60605851`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A7,C43
`Chr2:60605851`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A7,C43
`Chr2:60605889`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	90	A10,A11,A18,A22,A24,A25,A3,A6,A7,B1,B105,B108,B109,B11,B123,B128,B129,B134,B140,B18,B19,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B3,B31,B34,B40,B41,B46,B49,B5,B50,B53,B55,B58,B60,B62,B63,B69,B71,B78,B79,B8,B83,B86,B99,C1,C12,C18,C19,C2,C23,C27,C28,C30,C31,C32,C33,C35,C4,C41,C43,C44,C45,C48,C49,C56,C59,C61,C64,C66,C68,C70,C71,C75,C76,C77,C79,C8,C81,C86,C9,D10,D11,D4,D6
`Chr2:60605940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794448.1

237 aa

118

237

Homeodomain

PF00046 Homeodomain 80-139 aa

XP_057794449.1

210 aa

105

210

Homeodomain

PF00046 Homeodomain 80-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794448.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	80	139	3.6e-15	56.2	Homeodomain
`XP_057794449.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	80	139	2.9e-15	56.5	Homeodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938466.1
TTTTTTATGTGTAGACCCCAACTTTTCATTTCTCTTTTTAAACATGGAAATCATAAGTCAACCTCACCTCATCATTTGGTCTTGGTTAATAATCTATCTACTGCCATGCATCACTCCACTTTCTTTTTTCTTTAACCTTTGTATTATGCCTCTCCTTCCTTCTCTCACATCACCTTAGCTTTTTCTATATAAGCATCACACAATTTGATATCAAATTAAATTCATACATTCCATGGGAATTCAAGCCATGAAGGTGCATC...

XM_057938465.1
CTTTTTTCTTTAACCTTTGTATTATGCCTCTCCTTCCTTCTCTCACATCACCTTAGCTTTTTCTATATAAGCATCACACAATTTGATATCAAATTAAATTCATACATTCCATGGGAATTCAAGCCATGAAGGTGCATCACCTGCCACGTGGACTAATCTGGGATCACGACCCCCCTTCTCTCACCCTCGGCTGCAAGCGCTTCCGCCCCCTCGCCCCCAAGCTCTCCACCGCCACCGCCGCCACCTTCGATCTCAAGAGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010806
ATGGGAATTCAAGCCATGAAGGTGCATCACCTGCCACGTGGACTAATCTGGGATCACGACCCCCCTTCTCTCACCCTCGGCTGCAAGCGCTTCCGCCCCCTCGCCCCCAAGCTCTCCACCGCCACCGCCGCCACCTTCGATCTCAAGAGCTTCATCAAACCCGATCAATGTAGTCCAAGAAGCTCAGACGCTCAGAAGAAAGAATCATCTCAGGTAGAGGCGGCGCAGGCGGGCGGAACGCGGTGGAATCCGACGCAGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057794448.1
MGIQAMKVHHLPRGLIWDHDPPSLTLGCKRFRPLAPKLSTATAATFDLKSFIKPDQCSPRSSDAQKKESSQVEAAQAGGTRWNPTQEQIGILEMLYRSGMRTPNAQQIEQITAQLGKYGKIEGKNVFYWFQNHKARERQKQKRTSLGLSPSARTPSSIFLSSPNEVRPLINSARVFMKLNTIKCFYKKWCMQEEENNRYKRKCVFDEVNKYCREEEEQDRTLKLFPLHPEGRSSLRD

XP_057794449.1
MGIQAMKVHHLPRGLIWDHDPPSLTLGCKRFRPLAPKLSTATAATFDLKSFIKPDQCSPRSSDAQKKESSQVEAAQAGGTRWNPTQEQIGILEMLYRSGMRTPNAQQIEQITAQLGKYGKIEGKNVFYWFQNHKARERQKQKRTSLGLSPSARTPSSIFLSSPNEEEENNRYKRKCVFDEVNKYCREEEEQDRTLKLFPLHPEGRSSLRD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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