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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003867`

染色体: Chr02 坐标: 60643014-60644448 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003867`
名称	SmilChr02G003867
描述	uncharacterized SmilChr02G003867
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	60643014 - 60644448 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009829`
GeneID	`131009829`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009829`
原始查询	`SmilChr02G003867`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240332]; symbol=AT2G06541; hit=AT2G06541; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240332]; symbol=AT2G06541; hit=AT2G06541; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G06541` (AT2G06541) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240332] identity=37.9; qcov=0.894; evalue=1.22e-59; confidence=medium
Rice	`Os05g0311600` - identity=57.8; qcov=0.27; evalue=7.2e-36; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371); PF27073 (FAM200-ZBED5_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009829

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793218.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057793218.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793218.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793218.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793218.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:60643034`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B78,C73
`Chr2:60643034`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B78,C73
`Chr2:60643036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:60643061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B117,C2,C75
`Chr2:60643122`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A22,A4,A8,A9,B102,B125,B137,B15,B17,B28,B3,B4,B58,B62,B65,B69,B85,C11,C21,C28,C31,C33,C34,C46,C52,C60,C69,C84,C86,D9
`Chr2:60643126`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A1,A14,A19,A20,A21,B103,B104,B114,B127,B136,B48,B79,B84,C27,C3,C43,C5,C53,C75,D1
`Chr2:60643176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr2:60643188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:60643244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C32
`Chr2:60643302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr2:60643374`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	156	A10,A15,A18,A19,A2,A20,A23,A24,A4,A5,A7,A8,A9,B101,B102,B103,B104,B106,B107,B109,B11,B111,B112,B114,B115,B119,B12,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B135,B136,B137,B139,B14,B15,B16,B18,B2,B20,B27,B3,B30,B31,B32,B34,B35,B36,B37,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B51,B52,B53,B54,B55,B58,B59,B60,B61,B62,B65,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B75,B78,B79,B81,B82,B85,B87,B89,B9,B91,B95,B97,B98,B99,C10,C11,C12,C16,C17,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C32,C36,C38,C39,C40,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C50,C52,C53,C54,C57,C58,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C72,C74,C77,C78,C80,C81,C83,C84,C85,C86,C9,D11,D3,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr2:60643376`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	125	A11,A14,A16,A18,A22,A23,A24,A25,A3,A8,B10,B100,B102,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B119,B123,B128,B13,B131,B133,B134,B137,B138,B140,B16,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B24,B25,B26,B29,B3,B30,B40,B41,B42,B43,B48,B50,B54,B57,B59,B6,B60,B62,B63,B65,B66,B68,B69,B71,B72,B73,B75,B78,B8,B82,B83,B88,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B98,B99,C1,C13,C14,C15,C18,C19,C2,C21,C23,C26,C28,C30,C31,C32,C33,C35,C37,C38,C4,C41,C44,C45,C47,C48,C52,C59,C6,C60,C64,C66,C67,C68,C7,C70,C72,C74,C76,C79,C8,C82,C84,C87,C9,D10,D2,D4,D5,D6,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793218.1

378 aa

189

378

DUF4371

FAM200-ZBED5_RNase-like

PF14291 DUF4371 40-263 aa PF27073 FAM200-ZBED5_RNase-like 163-267 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793218.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	40	263	1.3e-77	261.2	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057793218.1`	Pfam	`PF27073`	FAM200-ZBED5_RNase-like	Domain	163	267	6e-11	43.0	FAM200/ZBED5 RNase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937235.1
ATGGATATGGATAGTCACTATCCGTCCCCGTCGTACCCAATTGCCATCCCTAGTATGGAGGCAATGCTTTTGTTGTTGGTGGCTTTCGAGCTTGGAAAAGAGTTAACAATTGGAAAAAAATGTGCTTTTCTAATCCATGTAGGAAGTGCTCCCAATTCTGCACATAAAGTAGCTGTGAAATGTTGTCTTGATTTGATGAACTCATTGCAGCACATTGGCAGAGTTGTTGACAAACAAACACCCGAGTTAGTTAGAAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009829
ATGGATATGGATAGTCACTATCCGTCCCCGTCGTACCCAATTGCCATCCCTAGTATGGAGGCAATGCTTTTGTTGTTGGTGGCTTTCGAGCTTGGAAAAGAGTTAACAATTGGAAAAAAATGTGCTTTTCTAATCCATGTAGGAAGTGCTCCCAATTCTGCACATAAAGTAGCTGTGAAATGTTGTCTTGATTTGATGAACTCATTGCAGCACATTGGCAGAGTTGTTGACAAACAAACACCCGAGTTAGTTAGAAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793218.1
MDMDSHYPSPSYPIAIPSMEAMLLLLVAFELGKELTIGKKCAFLIHVGSAPNSAHKVAVKCCLDLMNSLQHIGRVVDKQTPELVRKNRLQVKASIDVAKLCALLGIAFRGRDESPDSHNREFFLEILKYTASYNEEVASVVLENAPKNALYTSHSIQKDILSVYASKIQKFIRAEIGDEKFCIIVDESQDESKREQMAIILRFVDKDEFVHERFFDIVHVEDTKAATLKNKISGVLSYHNLSIQSIRGQGYDGASNMRGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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