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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003869`

染色体: Chr02 坐标: 60702335-60705004 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003869`
名称	SmilChr02G003869
描述	transcription factor SPATULA-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	60702335 - 60705004 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010812`
GeneID	`131010812`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010812`
原始查询	`SmilChr02G003869`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor SPATULA-like
产物	transcription factor SPATULA-like
Arabidopsis	`AT4G36930` (SPT) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829847] identity=50.5; qcov=0.643; evalue=3.21e-39; confidence=medium
Rice	`Os02g0805250` (OsbHLH107) - identity=62.9; qcov=0.41; evalue=1.05e-37; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00010 (HLH); PF23177 (bHLH_IRO3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010812

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794458.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794458.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794458.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794458.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794458.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:60702989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,C34,D9
`Chr2:60703506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:60703675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:60704486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:60704566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B41,C49,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794458.1

283 aa

142

283

HLH

bHLH_IRO3

PF00010 HLH 104-151 aa PF23177 bHLH_IRO3 108-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794458.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	104	151	1.3e-14	54.4	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057794458.1`	Pfam	`PF23177`	bHLH_IRO3	Domain	108	161	4.7e-07	30.8	Iron-related transcription factor 3 bHLH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938475.1
ACAAACCTTGTCTACAAACTCTATAACCATAAACCATTTTCCAGAAGAGGAAAAGTACAGGAAACCGCTCTCTTTTCCGAGTTTAGAAATTTAAAAATATCGATTTCAGCAATATTTTCTTGATGGGAATATGAAAAAGCTGCAATCTTGAAATGGGTTTCTACGATGCAGCAAAATAAACCAATAATAAGCGAAACTCCTTTGGTTTTTTGACTTCAATGTCTGCTTATTTCCATCAGAACCATTGTGCCTCTGAATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010812
ATGTCGGATCTTTACGGAAGCAATGAATCTGAAGACATGTCGTCTTTCCTTCAAATTCTTCTGCAAAACTCGTCATCTTCTGCCGCCACCAGCGACAGCGCTGCGGCCGCCGGAGGCTTGTTCGGCGGAGGAGGGGCGGTGGCGGAGTCCTCCACCAGCATCAGTTTCTCCGATCCCAGCTGCTTCTTCGCCAGAGAATCTGGTGGGGTGAGAGGCAAGAATCTGGCTTCCACTTGTGAGGGAGGTGATGCTTGTGATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794458.1
MSDLYGSNESEDMSSFLQILLQNSSSSAATSDSAAAAGGLFGGGGAVAESSTSISFSDPSCFFARESGGVRGKNLASTCEGGDACDVPVNPVPPRSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKLKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLTMRNGLSLHPGYSLGSLQSMLAPSGGLDIDEGDPLLHANRGLSRDQDVFMQSSIAPTSHGPSTLPTLMPNTTSASMLPSFAPPLQNRYGLLNHMASTKDICRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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