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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003871`

染色体: Chr02 坐标: 60725835-60728328 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003871`
名称	SmilChr02G003871
描述	subtilisin-like protease SBT3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	60725835 - 60728328 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010815`
GeneID	`131010815`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010815`
原始查询	`SmilChr02G003871`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT3
产物	subtilisin-like protease SBT3
Arabidopsis	`AT5G67090` (AT5G67090) Subtilisin-like serine endopeptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836844] identity=40.3; qcov=0.999; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os05g0435800` (OsSub47) - identity=47.9; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010815

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057794459.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057794459.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794459.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794459.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794459.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:60725997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D11
`Chr2:60726129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:60726175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C60
`Chr2:60726225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr2:60726248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D11
`Chr2:60726324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:60726346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:60726378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A18,B16,B36,B61,B99,C1,C10,C34,C50,D9
`Chr2:60726381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D11
`Chr2:60726406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B125,B21,B52,D8
`Chr2:60726453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D11
`Chr2:60726480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794459.1

762 aa

381

762

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 24-105 aa PF00082 Peptidase_S8 130-573 aa PF17766 fn3_6 649-753 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794459.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	24	105	6.5e-19	69.1	Peptidase inhibitor I9
`XP_057794459.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	130	573	6e-48	164.3	Subtilase family
`XP_057794459.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	649	753	2.3e-27	95.7	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938476.1
TAATAAGATAAGGTGCAATAATTAAGCAAATTTTGAAAACGAAAGAAATAAAGAACAAGACAGTTTCTGTTAGAAGCAAGAAATCAATAGCATTTCTCAAGATTCAGACAACAAAATGGAGGTGTTTCAGTTAGTTTCGATGATTCTGGTTTCTTGGTCTGTGCTGGTTTCAGCAGACAGATCAACTTACATTGTACACATGGACAAATCTCTCATGCCTAAGGCATTCTCCACTCACCATCATTGGTATTCTTCCCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010815
ATGGAGGTGTTTCAGTTAGTTTCGATGATTCTGGTTTCTTGGTCTGTGCTGGTTTCAGCAGACAGATCAACTTACATTGTACACATGGACAAATCTCTCATGCCTAAGGCATTCTCCACTCACCATCATTGGTATTCTTCCCTTCTTAAATCAGTAGCTCGGACGTGGCTCGACGCCGACGGATCCGAGCCGAAGCTCGTCCACACTTACGACAACGCCTTTCACGGTTTCTCCGCGGTGATGTCGGAATCCGAAGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794459.1
MEVFQLVSMILVSWSVLVSADRSTYIVHMDKSLMPKAFSTHHHWYSSLLKSVARTWLDADGSEPKLVHTYDNAFHGFSAVMSESEVAALKKSPGFLSAYPDDVVTPDTTHSYKFLSLNTATGLWPASQYGKDVIIGVVDSGIWPESPSFNDDGMTGIPARWKGICQAGDQFNSSHCNKKLIGARYFNEGSRASNPDINITMNSARDESGHGTHVASTAAGNYVDDVSFFGYAGGRARGVAPRARLAAYKVTGWDSGSVES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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