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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003873`

染色体: Chr02 坐标: 60771051-60773525 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003873`
名称	SmilChr02G003873
描述	prefoldin subunit 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	60771051 - 60773525 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010817`
GeneID	`131010817`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010817`
原始查询	`SmilChr02G003873`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	prefoldin subunit 2-like
产物	prefoldin subunit 2-like
Arabidopsis	`AT3G22480` (PDF2) prefoldin 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821819] identity=70.7; qcov=0.966; evalue=9.23e-68; confidence=high
Rice	`Os11g0568500` - identity=74.3; qcov=0.993; evalue=3.78e-73; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006457 (protein folding); GO:0016272 (prefoldin complex); GO:0044183 (protein folding chaperone); GO:0051082 (GO:0051082)
KEGG	-
Pfam	PF01920 (Prefoldin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010817

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794461.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057794461.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057794461.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794461.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794461.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:60771306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C18,C39
`Chr2:60771312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C15,C2,C32,C68,C8
`Chr2:60771362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C2,C32,C68,C8
`Chr2:60771450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:60771575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794461.1

145 aa

145

Prefoldin_2

PF01920 Prefoldin_2 15-118 aa

XP_057794462.1

145 aa

145

Prefoldin_2

PF01920 Prefoldin_2 15-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794461.1`	Pfam	`PF01920`	Prefoldin_2	Coiled-coil	15	118	2.1e-25	89.4	Prefoldin subunit
`XP_057794462.1`	Pfam	`PF01920`	Prefoldin_2	Coiled-coil	15	118	2.1e-25	89.4	Prefoldin subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938478.1
TATTATTTTTTCTATCCAACATCTCGCCGGTTCTCTCTCTAAAGAAAATCAGGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTCTTGCTCTCGTCGCCTCCCCTCCCCTCCCTTCATAGGATCCGGCATCTCTTCGCCGTCGACCACTACCACGACCACCCTCATCTCTCTATCCAATTTCTCTCTTTTACAACCCCCAGCCCTTGCTCTCTCTCACTTCTCTCGGTCGTCCCGCGAGAAATCGCCGTCACCGCCGCTGCCC...

XM_057938479.1
ATTTTTTCTATCCAACATCTCGCCGGTTCTCTCTCTAAAGAAAATCAGGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTCTTGCTCTCGTCGCCTCCCCTCCCCTCCCTTCATAGGATCCGGCATCTCTTCGCCGTCGACCACTACCACGACCACCCTCATCTCTCTATCCAATTTCTCTCTTTTACAACCCCCAGCCCTTGCTCTCTCTCACTTCTCTCGGTCGTCCCGCGAGAAATCGCCGTCACCGCCGCTGCCCTCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010817
ATGGCCAGGTCTGAAGGTGATATCAAAGAACCGATGAACGAGCAAGCCATTGCAAATATATATGCTTCCATGAGGAATGAAATCAACCAAATCTACTCCAAGATCACTGAGCTGGAAATGGAGGTCAGTGAGCACTCCCTCGTGATCAACGCCATAAAACCACTTGATCAATCAAGGCGATGCTACCGGATGATTGGAGGTGTACTTGTTGAGAGAACAATCAGAGAAGTTCTGCCAGCTGTGCAGAGAAATAAGGAGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057794461.1
MARSEGDIKEPMNEQAIANIYASMRNEINQIYSKITELEMEVSEHSLVINAIKPLDQSRRCYRMIGGVLVERTIREVLPAVQRNKEGLEEVIARLNEASEKKKKDLAEFEAKYKIRIRKGDGEMKDESKKEGNAQGVLVGPAGSN

XP_057794462.1
MARSEGDIKEPMNEQAIANIYASMRNEINQIYSKITELEMEVSEHSLVINAIKPLDQSRRCYRMIGGVLVERTIREVLPAVQRNKEGLEEVIARLNEASEKKKKDLAEFEAKYKIRIRKGDGEMKDESKKEGNAQGVLVGPAGSN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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