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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003894`

染色体: Chr02 坐标: 61019991-61023969 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003894`
名称	SmilChr02G003894
描述	uncharacterized SmilChr02G003894
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61019991 - 61023969 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010836`
GeneID	`131010836`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010836`
原始查询	`SmilChr02G003894`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=26.2; qcov=0.643; evalue=1.11e-57; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=29.2; qcov=0.647; evalue=4.65e-69; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010836

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794486.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794486.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794486.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794486.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794486.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61020672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C38
`Chr2:61020692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C38
`Chr2:61021125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:61021135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,C87,D6
`Chr2:61021365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,C87,D6
`Chr2:61021679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:61021711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr2:61021719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr2:61021772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A6,B52,B55,B79,C61
`Chr2:61021772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B52,B55,B79,C61
`Chr2:61021801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A2,B10,B105,B138,B84,C18,C49
`Chr2:61021882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794486.1

872 aa

436

872

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 487-581 aa PF00872 Transposase_mut 504-657 aa PF04434 SWIM 732-762 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794486.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	487	581	1e-19	71.4	MULE transposase domain
`XP_057794486.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	504	657	2.3e-10	40.6	Transposase, Mutator family
`XP_057794486.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	732	762	8.2e-08	32.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938503.1
GATAGATGTTTTTTTGGTTCCTATGTGTGTTTTGAGTGCTAATATGGATTGTGTTAATTTTTTGTATTTATATTCCATCGATTAATTAGCCTTCAATTAAGGGACATAAATTTTTTTTTTTTTAAATTGATGATAAACGACAAATATGATGTGAAATAGCTTTGTCAGTAAAGTATTCATGTCAAACACTCTAATTTCATTGAAATTCACGTGAAATGAAGGAAACTTTGTTTATATATGAGTGAATTCTCTCATCCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010836
ATGAATGAATATGGGAGATACTTTGTGGTTAATTATGGAGGTGCCTTCAATGGTTATGAGTACATCGGCGGCTCTTCTAAGAATTTGCATATTTTCGGAGACACAATGGCCAGTACGGTGTACATGATAAATTACCTGATGATGGAGAATTCATTGAGCACTAATTACAGCTTGTATTATTTGACGAAGAGATTAAATGGCAGGGTATACAGTAAAAATATTCTTGCCGATGACAATGATTTGCTTCAGTTGCTGGCGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794486.1
MNEYGRYFVVNYGGAFNGYEYIGGSSKNLHIFGDTMASTVYMINYLMMENSLSTNYSLYYLTKRLNGRVYSKNILADDNDLLQLLASQPHFPEIYVVEDDYSGGVYVPSFDLPQSFGYGGESSATFEGGDGLEAIQRYAYLDLSAGDSPAQQSVEPSVTWGNDQSTGWPSWDEPNTYQYDRPTTDRCWGPADDQYTYEPQFVEDAGNVDEDYVPSSEAETDTSASEDLSEPENVRRAGIEYAGWQNLQIDEDDDEQVPGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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