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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003902`

染色体: Chr02 坐标: 61110995-61114315 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003902`
名称	SmilChr02G003902
描述	protein CYPRO4
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61110995 - 61114315 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010846`
GeneID	`131010846`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010846`
原始查询	`SmilChr02G003902`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CYPRO4
产物	protein CYPRO4
Arabidopsis	`AT4G33400` (AT4G33400) Vacuolar import/degradation, Vid27-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829477] identity=68.5; qcov=0.938; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0178500` - identity=63.8; qcov=0.943; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF08553 (VID27); PF23581 (DUF7135)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010846

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057794505.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057794505.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057794505.1`
4	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.20000	`XP_057794505.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794505.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61111684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C16
`Chr2:61111740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr2:61111782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr2:61111796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:61111798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:61111864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C54,C56,C65
`Chr2:61112181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C34,D9
`Chr2:61112653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B22
`Chr2:61113841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr2:61113980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:61114014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:61114034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B122,B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794505.1

644 aa

322

644

DUF7135

VID27

PF23581 DUF7135 45-211 aa PF08553 VID27 266-584 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794505.1`	Pfam	`PF23581`	DUF7135	Domain	45	211	2.7e-73	245.9	Domain of unknown function (DUF7135)
`XP_057794505.1`	Pfam	`PF08553`	VID27	Repeat	266	584	8.1e-46	157.4	VID27 C-terminal WD40-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938522.1
AAACTCTTGAAATCAGTTGCTAGTCACCAGTTGGTATTTTTTAAAAGAAAATCGGCTAATAACCCTAGAAAAACCAAACCTCCATATTCAAACTTTTCAACTCCCGCTCCCCTCTCTCTCTCTCTAAGCCGTCGCAATGGGCGCCAACGCCAGCAGAGATCTGGATCTCTCCGACTCGGAATCCGAAACCGAATCTCAGGAAACCACCCGCCAGGAATCGGATTCCGAAGAAACCTACTGCACGCCGTCGTCGCAACCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010846
ATGGGCGCCAACGCCAGCAGAGATCTGGATCTCTCCGACTCGGAATCCGAAACCGAATCTCAGGAAACCACCCGCCAGGAATCGGATTCCGAAGAAACCTACTGCACGCCGTCGTCGCAACCATCCGACCGGAAGCGCGACGACCCCAAAACGCCGTCTTCGATTGACGAAGTCGAAGCGCGCCTCAAAGCGCTCAAACTCAAGTACAACAACAGCAACAACTCCAGTAACCCGAATCTGAAGAACGCGGTGAAGCTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794505.1
MGANASRDLDLSDSESETESQETTRQESDSEETYCTPSSQPSDRKRDDPKTPSSIDEVEARLKALKLKYNNSNNSSNPNLKNAVKLYLHVGGHTAKSKWVVSEKLVSYSFVKAALNDDEEDDEYDDGGRSDSNSCWLLKIGSKVRARVDENLQLKAFKEQRRADFVANGVWAIRFFSGEEWDRFTKMYQDCLFENTYGYEANDANKLKVYGKDFIGWANPEAADDSMWEDAEMKTPPSKTRIRRGNDLTEEFEEAAANGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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