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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003909`

染色体: Chr02 坐标: 61141637-61144920 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003909`
名称	SmilChr02G003909
描述	uncharacterized SmilChr02G003909
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61141637 - 61144920 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010851`
GeneID	`131010851`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010851`
原始查询	`SmilChr02G003909`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0525200; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os09g0525200; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G12650` (AT1G12650) rRNA biosis RRP36-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837821] identity=57.3; qcov=1.01; evalue=6.2e-76; confidence=high
Rice	`Os09g0525200` - identity=56.6; qcov=0.902; evalue=2.37e-78; confidence=high
GO	GO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0005730 (nucleolus); GO:0030686 (90S preribosome)
KEGG	-
Pfam	PF06102 (RRP36)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010851

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794512.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057794512.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794512.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794512.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794512.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61141987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr2:61143541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B33,B40,C43,C48
`Chr2:61144452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B50,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794512.1

245 aa

122

245

RRP36

PF06102 RRP36 67-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794512.1`	Pfam	`PF06102`	RRP36	Family	67	232	6.9e-53	179.7	rRNA biogenesis protein RRP36

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938529.1
AATGAGCAAACAACGAATTCTTCTTATACAAAGCCCCACACCCCCCCCCCCCCCCGCCCTGCTCTCCTTCGCCGCCTTCTTCCACAAACTCGGCGCTCAACTCGCCGGTAATTTCTCGCCGTCTACTTAATCGCTGTACTCGATATTCATCCTAGATTTGATATGAAGAACTCGGAGCCCTCAATTGCAACTTCAACTAAAATTACGTTTGATGACAGTGATGACCACGAAACTTCCTCTGGAGAAGAGGATATCATAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010851
ATGAAGAACTCGGAGCCCTCAATTGCAACTTCAACTAAAATTACGTTTGATGACAGTGATGACCACGAAACTTCCTCTGGAGAAGAGGATATCATAGAGCGTGAGCTTGCTGAAGTAACATTCGAGGAGCTGCAGAGGGCGAGGTCTGATGGTTCTGATTTGGTTTACAGGAAGCCTAAGCCAGAGAAGAAAGGCGGTCGGGCTAATAAGAATAGGCCGATGGAAATCAGTAGCAAGAAGCCTGTTAGTAGATTCAGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794512.1
MKNSEPSIATSTKITFDDSDDHETSSGEEDIIERELAEVTFEELQRARSDGSDLVYRKPKPEKKGGRANKNRPMEISSKKPVSRFREVIQAPKKVVRDPRFESLCGNLDVDGFKKRYNFIYENTLPVEKEELKKQMKKTKDPEAINDLKDRLTRIDKELKSVAAKRTEKDILAEHKKKEREAAKKGKQPYYLKKSEIQKHKLAEKFKELKESGKLESFIEKKRRRNAAKDHRYMPYRRPTEQGNQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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