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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003916`

染色体: Chr02 坐标: 61250076-61251642 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003916`
名称	SmilChr02G003916
描述	B3 domain-containing protein At5g42700-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61250076 - 61251642 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010858`
GeneID	`131010858`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010858`
原始查询	`SmilChr02G003916`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 domain-containing protein At5g42700-like
产物	B3 domain-containing protein At5g42700-like
Arabidopsis	`AT5G42700` (AT5G42700) AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834279] identity=57; qcov=0.978; evalue=5.79e-74; confidence=high
Rice	`Os06g0194400` - identity=50; qcov=0.965; evalue=6.49e-66; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010858

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794519.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794519.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794519.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794519.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794519.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61250319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:61250362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr2:61250468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:61250538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B41
`Chr2:61250538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:61250546`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A20
`Chr2:61250546`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A20
`Chr2:61250738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B102,C84
`Chr2:61250849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr2:61251074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B126,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794519.1

244 aa

122

244

PF02362 B3 129-214 aa

XP_057794520.1

228 aa

114

228

PF02362 B3 129-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794519.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	129	214	4.9e-16	59.2	B3 DNA binding domain
`XP_057794520.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	129	214	3.4e-16	59.7	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938536.1
CACCCGGTTGACCTATTTTGTTGGAAAATAAATCTAAAAAATACGCTAGGTAAAATTAATAAATTTATTACCGTAGCAGTGAGTCAGAAGTGGGACTCCAACGGTCAATTTTGCCACCAATATTTGAACTAGAAGCTTAGCTGTGTCTCTCTTCATGGTTTAGAAACTCAAGCGCTGCTCTGTTCGTCTCTCTCTATCTCTTTAGTTTTGGATTATATTGTTGAAGAAGATAGGTGTGAAAATGGTGATGGCAAAGGTGA...

XM_057938537.1
CTATTTTGTTGGAAAATAAATCTAAAAAATACGCTAGGTAAAATTAATAAATTTATTACCGTAGCAGTGAGTCAGAAGTGGGACTCCAACGGTCAATTTTGCCACCAATATTTGAACTAGAAGCTTAGCTGTGTCTCTCTTCATGGTTTAGAAACTCAAGCGCTGCTCTGTTCGTCTCTCTCTATCTCTTTAGTTTTGGATTATATTGTTGAAGAAGATAGGTGTGAAAATGGTGATGGCAAAGGTGAAGTATGAAGCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010858
ATGGTGATGGCAAAGGTGAAGTATGAAGCTGTACGGCAGCAGAGATTGGAAGAGAACAAGAAACGAATAGAGGAACTCCATCTCCCTCTTCTCTCTCAAGCCCTCAAAGATTCCTCCTCTCCTAAGCCCTCTCCGATGAAGAAGACTAAACCTCGGATTGCGAGGACTGAGGTGGTTCCTGTGAGAAGATCATTGCGATTTTCCAACAAATCGGCTCCGGAATACAAGGAGATTACTGTCTACGACCGCGTGCACATCCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057794519.1
MVMAKVKYEAVRQQRLEENKKRIEELHLPLLSQALKDSSSPKPSPMKKTKPRIARTEVVPVRRSLRFSNKSAPEYKEITVYDRVHIPRRMTHKTRDLSNRVYASDQARDIAMKKAEEIESSLGSNHPSFVRSMLPSHVSGGFWLGLYSDFCRRRLPRNDGVVQLVDEEGEEWPVVYLARKTGLSGGWKKFAVDHNLVDGDALVFQLIKPTVFKVLLYPIFLVLDYHNAISLSNVWILAGLHCES

XP_057794520.1
MVMAKVKYEAVRQQRLEENKKRIEELHLPLLSQALKDSSSPKPSPMKKTKPRIARTEVVPVRRSLRFSNKSAPEYKEITVYDRVHIPRRMTHKTRDLSNRVYASDQARDIAMKKAEEIESSLGSNHPSFVRSMLPSHVSGGFWLGLYSDFCRRRLPRNDGVVQLVDEEGEEWPVVYLARKTGLSGGWKKFAVDHNLVDGDALVFQLIKPTVFKVFIVRVDSETIKVEL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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