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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003934`

染色体: Chr02 坐标: 61409285-61410546 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003934`
名称	SmilChr02G003934
描述	VQ motif-containing protein 9-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61409285 - 61410546 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010899`
GeneID	`131010899`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010899`
原始查询	`SmilChr02G003934`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	VQ motif-containing protein 9-like
产物	VQ motif-containing protein 9-like
Arabidopsis	`AT1G78310` (AT1G78310) VQ motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844166] identity=38.7; qcov=1.04; evalue=4.59e-37; confidence=medium
Rice	`Os03g0190000` - identity=88; qcov=0.076; evalue=2.7e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05678 (VQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010899

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794585.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057794585.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057794585.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794585.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794585.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61409407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr2:61409436`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	102	A1,A14,A19,A21,A23,A25,A5,A7,A8,A9,B102,B104,B107,B111,B117,B120,B123,B124,B127,B129,B131,B132,B134,B135,B138,B139,B140,B16,B23,B24,B27,B29,B34,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B48,B5,B50,B52,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B65,B68,B71,B74,B77,B79,B81,B82,B83,B87,B91,B94,B96,C1,C10,C13,C14,C19,C2,C20,C23,C24,C28,C32,C33,C35,C37,C42,C45,C47,C50,C54,C55,C57,C59,C60,C62,C63,C65,C66,C69,C7,C72,C74,C75,C76,C77,C82,C86,C87,D1,D2
`Chr2:61409439`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B68,B92,C1,C27,D4
`Chr2:61409439`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B68,B92,C1,C27,D4
`Chr2:61409440`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	112	A1,A14,A19,A21,A23,A25,A5,A7,A8,A9,B101,B102,B103,B104,B107,B111,B117,B120,B123,B124,B126,B127,B129,B131,B132,B134,B135,B138,B139,B140,B16,B23,B24,B27,B29,B33,B34,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B48,B5,B50,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B65,B69,B71,B74,B77,B79,B81,B82,B83,B84,B87,B91,B94,B96,C1,C10,C13,C14,C19,C2,C20,C23,C24,C28,C29,C32,C33,C35,C37,C42,C45,C46,C47,C50,C54,C55,C57,C59,C6,C60,C62,C63,C65,C66,C69,C7,C72,C74,C75,C76,C77,C82,C86,C87,D1,D2
`Chr2:61409467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B94,C75
`Chr2:61409468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B68,B92,C1,C27,C29
`Chr2:61409481`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B41,B6,B79,B83,C47,C60
`Chr2:61409526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B68,B92,C27,D4
`Chr2:61409530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:61409536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:61409539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794585.1

327 aa

164

327

PF05678 VQ 89-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794585.1`	Pfam	`PF05678`	VQ	Motif	89	113	7e-10	38.9	VQ motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938602.1
ATGGATAAAGGATTTGTTGGTGGCGGTGCTGATGATTCAGCTTCTTCCGCATCTTACAGTAATAGTGGAAGCAGCTCCAGCAGCACTAGAGATGTGTATCTCAAACATGTAAGCAGGAATTCGCACAAAATTTCTAAGCCCATTCGGAAGCCTCTCCTTCTGCCTCCCGCCGTCGCTCCTGCGGCGGCGGCCTCGTTGTCGTCTTCCGCCGCCGGTATTTCGATTCTGGACCCTAATTCGAGCCAGGCGCAGCCCCAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010899
ATGGATAAAGGATTTGTTGGTGGCGGTGCTGATGATTCAGCTTCTTCCGCATCTTACAGTAATAGTGGAAGCAGCTCCAGCAGCACTAGAGATGTGTATCTCAAACATGTAAGCAGGAATTCGCACAAAATTTCTAAGCCCATTCGGAAGCCTCTCCTTCTGCCTCCCGCCGTCGCTCCTGCGGCGGCGGCCTCGTTGTCGTCTTCCGCCGCCGGTATTTCGATTCTGGACCCTAATTCGAGCCAGGCGCAGCCCCAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794585.1
MDKGFVGGGADDSASSASYSNSGSSSSSTRDVYLKHVSRNSHKISKPIRKPLLLPPAVAPAAAASLSSSAAGISILDPNSSQAQPQSQQPPVYNINKNDFRDVVQKLTGSPAHERFSAPGPPAPQTRPPSSRLQRIRPPPLSQIVNRPPQIGPQNSGAQQQPFTPLPPLPSVHPAAESPISAYMRFLQNSASAASASSLWNSAPRPDALIPQSDGPRAPPPAAESPVSAYMRFLQSSYSSSTAPPQWNATAPPQQSTLPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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