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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003939`

染色体: Chr02 坐标: 61529031-61529648 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003939`
名称	SmilChr02G003939
描述	uncharacterized SmilChr02G003939
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61529031 - 61529648 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009842`
GeneID	`131009842`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009842`
原始查询	`SmilChr02G003939`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=34.4; qcov=0.878; evalue=1.3e-33; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009842

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793230.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057793230.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793230.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793230.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793230.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61529054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C7
`Chr2:61529062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B140,D10,D11
`Chr2:61529067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B49,C58
`Chr2:61529074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:61529084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr2:61529105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B31,B67,B93
`Chr2:61529116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C40,C52,D8
`Chr2:61529127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	98	A1,A13,A15,A16,A21,A23,A4,A5,B101,B103,B105,B109,B112,B113,B117,B119,B120,B121,B123,B128,B132,B133,B134,B135,B137,B17,B18,B22,B23,B25,B27,B28,B29,B30,B34,B38,B39,B41,B45,B46,B47,B5,B51,B52,B55,B56,B59,B6,B63,B64,B66,B67,B7,B72,B73,B76,B77,B79,B80,B82,B83,B84,B87,B89,B94,B96,C23,C24,C29,C30,C31,C37,C4,C41,C47,C51,C52,C54,C56,C58,C59,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C73,C74,C82,C86,C9,D1,D11,D2,D6
`Chr2:61529128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A1,A18,A6,A9,B118,B121,B36,B37,B43,B51,B59,B61,B69,B72,B95,C29,C30,C37,C4,C41,C47,C5,C63,D7
`Chr2:61529129`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr2:61529129`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr2:61529183`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	86	A1,A11,A14,A3,A4,A7,A9,B102,B103,B107,B114,B12,B123,B127,B129,B13,B130,B131,B134,B136,B16,B18,B2,B21,B23,B25,B30,B33,B35,B4,B41,B47,B48,B54,B59,B61,B64,B65,B77,B78,B8,B80,B81,B85,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B98,C10,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C21,C22,C24,C29,C33,C34,C37,C38,C4,C46,C48,C53,C55,C56,C65,C74,C8,C81,C85,C87,D10,D11,D3,D6,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793230.1

205 aa

102

205

DUF7769

PF24964 DUF7769 11-62 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793230.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	11	62	1.5e-07	31.7	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937247.1
ATGTCTAACAGAAAGAGGCCCGATTTAGCAGTAGAGGAGAAACAGCGAGTCCTTCAATGGTTGCTGCAATACAATAAGGATGGAGTTCCTAACAGAGGGGCACCAAAGGAAGCAACTGCATTTTTCAACATTTCAGTCAAATCCGTCCGCAAAATCTGGGTGCATGCAAAGAAGCAAATAGAAAGAGGTGAAGTAGTGCATTTTCAAAACAAAAGAAAAGGTAAACAACATGTAGATAAAATGATGCCCGATGAAGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009842
ATGTCTAACAGAAAGAGGCCCGATTTAGCAGTAGAGGAGAAACAGCGAGTCCTTCAATGGTTGCTGCAATACAATAAGGATGGAGTTCCTAACAGAGGGGCACCAAAGGAAGCAACTGCATTTTTCAACATTTCAGTCAAATCCGTCCGCAAAATCTGGGTGCATGCAAAGAAGCAAATAGAAAGAGGTGAAGTAGTGCATTTTCAAAACAAAAGAAAAGGTAAACAACATGTAGATAAAATGATGCCCGATGAAGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793230.1
MSNRKRPDLAVEEKQRVLQWLLQYNKDGVPNRGAPKEATAFFNISVKSVRKIWVHAKKQIERGEVVHFQNKRKGKQHVDKMMPDEEKIRALPVKERSTIRRMAAKLGISKSLLGEWIKEKQLRAHTSAVKPFLTDDNKLARLRFSLSQLNSASILEDKLNFHSMHNVVHIDEKWFYMSNTSERYYLLPDEESANKPRKHQESERI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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