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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003940`

染色体: Chr02 坐标: 61537238-61542890 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003940`
名称	SmilChr02G003940
描述	uncharacterized SmilChr02G003940
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61537238 - 61542890 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010911`
GeneID	`131010911`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010911`
原始查询	`SmilChr02G003940`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838839]; symbol=AT1G22330; hit=AT1G22330; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838839]; symbol=AT1G22330; hit=AT1G22330; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G22330` (AT1G22330) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838839] identity=51.4; qcov=1.05; evalue=1.54e-66; confidence=high
Rice	`Os02g0714000` - identity=53; qcov=0.665; evalue=2.61e-55; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010911

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794602.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057794602.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794602.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794602.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794602.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61537636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:61538039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:61538293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:61538299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:61540230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B86
`Chr2:61540323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794602.1

272 aa

136

272

RRM_1

PF00076 RRM_1 19-76 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794602.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	19	76	6.7e-16	58.6	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938619.1
AGAGAGGACAGAGTCAAGTGCTCTTTAGTCACGCAGCTGTCATTCGAGTACACAAAACCCACAAATCCCAATTCCCTCCTCATATACAGCAAATCAGAGTTTGCAACTGTCGGATACCTTTTCCCACTTTCTCTCTCCACCACCTTATTACTTACACTACTACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCCCCCTAAGCTCCACCTCCGCCGCCACCAACTCCTATTGTGCATTGCGATGGATGGATCACTTTCAATGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010911
ATGGCTCACCACCAGCATTACCGATCGCCGTTCGGCGACACCACTCTCACTAAGGTTTTTGTCGGAGGCCTCGCCTGGGAAACTCCGACCGACGTAATGCGCGGCTACTTCGACCAGTTCGGAGATATCCTAGAGGCTGTCATTATCACGGACAAGAACACCGGCAAATCCAAGGGTTATGGATTTGTGACGTTTCAAGATCCCGAGTCAGCCCGGCGAGCTTGTGCCGATCCGAATCCTATGATCGATGGGAGAAGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794602.1
MAHHQHYRSPFGDTTLTKVFVGGLAWETPTDVMRGYFDQFGDILEAVIITDKNTGKSKGYGFVTFQDPESARRACADPNPMIDGRRANCNIASLGRPRPSPPRGRNQVANVYQGSGIAQGGMSSYLPLPPPPPPPPVPPHPPLIYPPYGYTSYSPDYAYQQQTMYNPHMQQSQYYNQLYGTSSSALGSPYYYGYAPRGAFSMPAAQRMPGPSYLYYPAQVEGTSLTYPPTPHPLPSLQPIRHSLPSPSDSLAPNQTSTET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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