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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003946`

染色体: Chr02 坐标: 61615521-61621034 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003946`
名称	SmilChr02G003946
描述	uncharacterized SmilChr02G003946
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61615521 - 61621034 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010867`
GeneID	`131010867`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010867`
原始查询	`SmilChr02G003946`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0485700; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os08g0485700; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G22310` (MBD8) methyl-CPG-binding domain 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838838] identity=35.7; qcov=0.305; evalue=1.98e-47; confidence=low
Rice	`Os08g0485700` - identity=36.3; qcov=0.218; evalue=1.07e-47; confidence=weak
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010867

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794538.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794538.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794538.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794538.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794538.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61615718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr2:61615728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,C32,C67,C69,D4
`Chr2:61615778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:61615783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B12,B14,B43
`Chr2:61615799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C58
`Chr2:61615806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B12,B131
`Chr2:61615827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B11,B12,D10
`Chr2:61615828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C58
`Chr2:61615849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr2:61615851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B12,D10
`Chr2:61615863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A20,B126,B26,B33,B38,B46,B67,B97,C40,C46
`Chr2:61615872`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A10,B131,C8,C82,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938555.1
TTAGGGATTTTAGTCGATTCAAATTTCAAATCCCCAATTTGAAGGGTTCGAAAAGTAATTTCAAACTCAGCTATTCCCACAATTAAAACCCCAAACCAACTTCCATATTCCGACCTTACTATGGCTTCTGCCACCGTCGATTCCGCCGCCGCGAGCACCGCAGACGGTGGCCTACTTCGATTGGATTCAATTCCCATCGTGGATCTCCGCCTACTCTCCCAATCGGAGCTTTATTCCCTCTCCCGCTGCTCTTCATCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010867
ATGGCTTCTGCCACCGTCGATTCCGCCGCCGCGAGCACCGCAGACGGTGGCCTACTTCGATTGGATTCAATTCCCATCGTGGATCTCCGCCTACTCTCCCAATCGGAGCTTTATTCCCTCTCCCGCTGCTCTTCATCCGCCTCCGACCCCAACCGCCGCGACGACGTCGTCATCCCAATTATCGACCGCTCCGTCTTCAACGAGTCCGCCGGCTCCCGGAAGCAGACCTACTCCCGCCTCCGCCTCGCCCCCACTGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794538.1
MASATVDSAAASTADGGLLRLDSIPIVDLRLLSQSELYSLSRCSSSASDPNRRDDVVIPIIDRSVFNESAGSRKQTYSRLRLAPTDSSSATPRCRTPHLRSTAAVYGATNSKSDPENAENHQIINLLKQFFVADMNPADLFPVKIEYLNSLPVQQFLSPPSPSPSNAPPPVLKRKRGRPRRTDYLGNVGDLAVEVSVIDASYMDRLQLPMPMPMPIPMPIPSLNEFVPRDNGEDKDREVLNSDGVAVDLAALGASEHPYW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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