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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003957`

染色体: Chr02 坐标: 61739925-61744657 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003957`
名称	SmilChr02G003957
描述	uncharacterized SmilChr02G003957
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61739925 - 61744657 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010869`
GeneID	`131010869`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010869`
原始查询	`SmilChr02G003957`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF09331 (DUF1985)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010869

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794540.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794540.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794540.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794540.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794540.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61740089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:61740115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,B52
`Chr2:61740121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr2:61740125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B75,C72
`Chr2:61740140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C72,D3
`Chr2:61740156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B72,C30,D6
`Chr2:61740170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C1
`Chr2:61740208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,D11
`Chr2:61740212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,D11
`Chr2:61740221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B33,C12,C6,D6
`Chr2:61740246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B33,C32,C68
`Chr2:61740263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B61,C7,C71,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794540.1

837 aa

418

837

DUF1985

Peptidase_C48

PF09331 DUF1985 104-232 aa PF02902 Peptidase_C48 695-832 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794540.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	104	232	5.9e-16	59.4	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057794540.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	695	832	3.8e-13	50.5	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938557.1
CCCGTCACCCTCCCCGCCGCATCACCCTTCCGCCGTCGTGACTCCCTCACCGACGCCGCCGCCGTCTCTCTGTCGTCATCGTCGCGCAGTGCTGGTCACCGCTGTCACCGTCGTCGTCTTCGCGCGGTGCTGCTCGCCGCCGTGACTCCCTCGCCGCCGTTGTGACTCCATCCCGCCGTCACCGCAAATCTCCAGTTCAAGCTACCAAATGTCGTCAGATGAACATTTAACGGAGAACAACGATTCAGACAACGATCCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010869
ATGTCGTCAGATGAACATTTAACGGAGAACAACGATTCAGACAACGATCCCGACAATCCAATTCAAGAGGGAGGATGGAAGTGGAAGAGACCTCTAATGAGAGGTGTTTCTTGTACAATAGTGACATACACGAAGGATTCAACCATTATGAATGGTATCCGTAGAGTTCTATCAGAAGAGGGAGAAGTCGCACTTAAGCAATTTGAGAAAAGCTGCTTTGGAAGATTTTTAAAGCTACCGGATTCAATTAACAAATGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794540.1
MSSDEHLTENNDSDNDPDNPIQEGGWKWKRPLMRGVSCTIVTYTKDSTIMNGIRRVLSEEGEVALKQFEKSCFGRFLKLPDSINKCNQAIHHVISHQIIFGEEADKTALWFRINNQNLRFSRFEYALVTGLQFGESAFNPYVEHEIHEHSLYHRELDGRPTTPTELLKKFLEGHLGDYAEDYVKAAKILFAYYIVLGDDGRRAIKDWVWALIEDTEAWNSFPWGSYSFQRLIFYIDGVQQTPTKDCVREQYHLYGAASSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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