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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003961`

染色体: Chr02 坐标: 61777382-61778980 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003961`
名称	SmilChr02G003961
描述	uncharacterized SmilChr02G003961
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61777382 - 61778980 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010908`
GeneID	`131010908`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010908`
原始查询	`SmilChr02G003961`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleolar GTP-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844147]; symbol=AT1G78110; hit=AT1G78110; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	nucleolar GTP-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844147]; symbol=AT1G78110; hit=AT1G78110; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G78110` (AT1G78110) nucleolar GTP-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844147] identity=44.8; qcov=1.2; evalue=8.48e-72; confidence=medium
Rice	`Os02g0753400` - identity=37.7; qcov=1.11; evalue=9.22e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30939 (At1g76070)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010908

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794596.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057794596.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057794596.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794596.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794596.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61777974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B78,B95,C14,D6
`Chr2:61778044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:61778088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B109,B66,C18,C5
`Chr2:61778126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr2:61778265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr2:61778329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr2:61778358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B8,C15,C36,C77
`Chr2:61778387`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	48	A14,A20,A24,A6,A7,B101,B108,B109,B12,B120,B127,B128,B133,B14,B18,B27,B34,B37,B4,B50,B59,B63,B64,B68,B7,B79,B91,B96,B99,C25,C28,C29,C32,C35,C36,C40,C43,C57,C6,C61,C64,C68,C75,C76,C83,D4,D5,D8
`Chr2:61778393`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C64
`Chr2:61778393`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C64
`Chr2:61778396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr2:61778398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794596.1

289 aa

144

289

At1g76070

PF30939 At1g76070 63-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794596.1`	Pfam	`PF30939`	At1g76070	Family	63	125	2.3e-07	31.8	Syringolide-induced protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938613.1
GTAACATAATTTCCTAGAATGAGAGTTTTATCATCTCATTTTACTTCCCATCCAATCATCATAAACTACACATCTCATTTCTTGATCGAGTTGTGTGGTCATACTCCTCATCATCAATGTTCCTAAATTTGGTATTAGTTCAAGAAAGAATTAATGAGGAGAATTAGGAAAACTCCCTATTTGATTTTCATCAAAAAAATCACCTCACTATTTGTCCCTCCGATTTTAGCAAGCTACCTAATAGAAGCTCAAAATAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010908
ATGATCAAAATGAGAGGCAGAGAGGGCAAAGGCCCTCCTTCAACCGATCTACTCGTATGCTTCCCATCTCGAGCTCACCTATCCCTCATGCCCAAGCCCATCTGCAGCCCGGCCCGCCCCTCCGATTCCTCCTCCTCCTCCTTCCACCGCCGCCGCCCCTCGCACCACCACCTCAGAAAATCCACCATGTGGGCCCGCACCAAACACAAGAATAATAACAGCAATGCAGATATCTCGGAACCCACCTCGCCGAAGGTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794596.1
MIKMRGREGKGPPSTDLLVCFPSRAHLSLMPKPICSPARPSDSSSSSFHRRRPSHHHLRKSTMWARTKHKNNNSNADISEPTSPKVTCAGQIKVKTKPNSCKNWQSVMEEIERMHNHRKQKKRAPWMEALGFKKEVMQFLTCLRKISLDFRCFGSIPAVEISSDDDEGEEEEEDEDDGGASGAVFSKWFMILQEDNNLRKDESVIVDDEAPPPPPPNALLLMRCRSAPAKSWLEEREEEEERERRNELEINKEEEETKGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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