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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003981`

染色体: Chr02 坐标: 62064507-62067225 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003981`
名称	SmilChr02G003981
描述	endoglucanase 5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62064507 - 62067225 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010920`
GeneID	`131010920`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010920`
原始查询	`SmilChr02G003981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endoglucanase 5-like
产物	endoglucanase 5-like
Arabidopsis	`AT1G48930` (GH9C1) glycosyl hydrolase 9C1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841315] identity=45.9; qcov=0.944; evalue=7.28e-27; confidence=medium
Rice	`Os04g0674800` (OsGH9C1) - identity=40.6; qcov=0.93; evalue=3.13e-28; confidence=medium
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00759 (Glyco_hydro_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010920

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057794611.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794611.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794611.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794611.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794611.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62066458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	160	A1,A10,A11,A13,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A24,A4,A6,A7,A9,B101,B103,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B118,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B127,B129,B13,B131,B132,B133,B135,B136,B138,B139,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B27,B28,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B4,B42,B43,B44,B45,B53,B54,B55,B56,B57,B59,B6,B60,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B72,B74,B75,B79,B80,B82,B84,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B97,B98,C10,C11,C13,C14,C2,C20,C22,C23,C24,C26,C27,C29,C30,C31,C32,C33,C36,C38,C4,C40,C42,C43,C44,C47,C48,C5,C51,C55,C56,C57,C6,C60,C61,C63,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4
`Chr2:62066487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B59,C10,D4,D9
`Chr2:62066508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B59,C62,D10
`Chr2:62066657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B131,C49
`Chr2:62066657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C49
`Chr2:62066773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B40,C8
`Chr2:62066790`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	42	A11,A18,A2,A23,A25,A4,A8,A9,B1,B101,B102,B110,B130,B131,B33,B37,B44,B49,B54,B57,B60,B62,B79,B88,B9,B91,B98,C12,C18,C20,C27,C33,C51,C60,C64,C66,C67,C75,C79,C84,D1,D7
`Chr2:62066826`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr2:62066826`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B140
`Chr2:62066943`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A10,B26
`Chr2:62066943`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A10,B26
`Chr2:62066951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794611.1

143 aa

143

Glyco_hydro_9

PF00759 Glyco_hydro_9 8-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794611.1`	Pfam	`PF00759`	Glyco_hydro_9	Repeat	8	130	6.7e-20	72.5	Glycosyl hydrolase family 9

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096697.1
TCCTCGCTCTGAAATCCGGCGACGACACAGCCACCGTCCATGTCTCCGCCCCTAGATCCCCAATCCAGATCTGAGACGGAGGCGGTGGCCTGAGGTGGAGGGCGGCAGATCGTGGGGGAAGAGGAAGTCGCGGTGGCCTCCGATGGTCGGGAGAGGAAGTCGCAGCGGCTGGGCTGCTTCGATGGCCTCGGATGCTCGGTGGTCGGGAGAGGAAGTCGCAGCGGCTGGGCTGCTTCGATGGCCTCGGAAGCTCGGTGGAC...

XM_057938628.1
ATTTAATCGCAATTTGCACCCGCGTTGACTAACACTTTGATCGGTGGTGACATGGCCATCGGATTTTGTTGACGTGGACGCACCGGCGATCAAGTAAAACGACGTCGTTTTTGTCAAGTTTTTTTAAATAAAAAAATAAATAAAAAAACAAAAAAACATGAAATCCGGCGCCCCTCCCCCTGACTCTCTCTCTCTCTGGCCCATTTCTCTCCCGCCGCGCCCCCTCTCTCCTCTGCTCCGGCGAGCAGCCAGCCGGCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010920
ATGCATGGAGGTGGAGGAGCATACACTTCCACATTGCAGCAATACCAAGCCAAGGCTGATTACTTCACCTGCGCCTGCATGCAGAAGAACGACAGCTACAATGTGCCCATGACTCCTGGTGGACTGCTCTATCTATGGGAGTGGAACAATCTGCAGTACTCTGCCTCTGCTGCATTCGTCATTCGGAATATCTTGCAAAGGCAAAAGGCGTTCTCATCTTTGCAAAATCACAAGTATATATATATATCAATCATCTTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794611.1
MHGGGGAYTSTLQQYQAKADYFTCACMQKNDSYNVPMTPGGLLYLWEWNNLQYSASAAFVIRNILQRQKAFSSLQNHKYIYISIIFFLLVCAEFATEKSNLWKADYILGKNPKNLSYVVGCGDNYPVHVHLPPRFRSGVYSRI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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