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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003989`

染色体: Chr02 坐标: 62140580-62141194 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003989`
名称	SmilChr02G003989
描述	uncharacterized SmilChr02G003989
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62140580 - 62141194 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009850`
GeneID	`131009850`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009850`
原始查询	`SmilChr02G003989`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0158600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0158600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=26.9; qcov=0.819; evalue=7.59e-10; confidence=low
Rice	`Os03g0158600` - identity=28.9; qcov=0.765; evalue=2.66e-10; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009850

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793238.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057793238.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057793238.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793238.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793238.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62140605`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A1,A11,A24,A4,A7,B108,B119,B123,B130,B133,B137,B2,B29,B30,B51,B54,B6,B66,B72,B77,B80,B87,B91,C3,C30,C37,C47,C52,C60,C67,C7,D5
`Chr2:62140618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B66,C49,C5
`Chr2:62140621`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	51	A11,A16,A18,A3,A5,B100,B108,B109,B11,B113,B125,B126,B131,B140,B15,B16,B26,B35,B48,B52,B58,B65,B67,B71,B75,B78,B82,C16,C19,C20,C21,C3,C30,C31,C36,C37,C48,C49,C50,C57,C6,C62,C7,C72,C76,C78,C79,C8,D4,D5,D8
`Chr2:62140657`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A5,D4
`Chr2:62140657`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A5,D4
`Chr2:62140662`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A5,D4
`Chr2:62140662`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A5,D4
`Chr2:62140665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:62140667`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A19,B126,B30,D11
`Chr2:62140667`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A19,B126,B30,D11
`Chr2:62140710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C37,C77
`Chr2:62140733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B13,C18,C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793238.1

204 aa

102

204

RVT_3

PF13456 RVT_3 71-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793238.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	71	176	2.3e-15	57.3	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937255.1
ATGGTGGTTTGGAAGAATGTTTTTCCTGTTCCGGCGACCTCGATTTCTCACGCGATCAATGCTCGGATGGAATGGTTGGTGGCCTGGGCCAAGAACTCGCTGAGAAGCACTCCGACGACAGCCAAGGCGATCTGCAAAGGCTGGCACGCTATCCCCTTGGATGCTGTCAAGTGCGATGTGGACGCAGCTTTCTTCAAGGAAGATGGCTCCATGGTTCACAACCATGAGGGCGCTTTCATTCGAGGGAAATCCTTTAAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009850
ATGGTGGTTTGGAAGAATGTTTTTCCTGTTCCGGCGACCTCGATTTCTCACGCGATCAATGCTCGGATGGAATGGTTGGTGGCCTGGGCCAAGAACTCGCTGAGAAGCACTCCGACGACAGCCAAGGCGATCTGCAAAGGCTGGCACGCTATCCCCTTGGATGCTGTCAAGTGCGATGTGGACGCAGCTTTCTTCAAGGAAGATGGCTCCATGGTTCACAACCATGAGGGCGCTTTCATTCGAGGGAAATCCTTTAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793238.1
MVVWKNVFPVPATSISHAINARMEWLVAWAKNSLRSTPTTAKAICKGWHAIPLDAVKCDVDAAFFKEDGSMVHNHEGAFIRGKSFKMPGLRSVEEGELIGIKEALSWLKELGFERGWVDSDSKRACDVINTGERNILELGAIASHCRDILELFPGIRVRHIRREQNAAAHYLAKAARDINSHHVWNEPPSFVVDHLHVPCSCDQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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