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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003991`

染色体: Chr02 坐标: 62210662-62215677 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003991`
名称	SmilChr02G003991
描述	aspartic proteinase-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62210662 - 62215677 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010875`
GeneID	`131010875`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010875`
原始查询	`SmilChr02G003991`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartic proteinase-like protein 1
产物	aspartic proteinase-like protein 1
Arabidopsis	`AT5G10080` (AT5G10080) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830872] identity=49.4; qcov=0.955; evalue=1.12e-159; confidence=high
Rice	`Os02g0751100` - identity=50.1; qcov=0.893; evalue=2.45e-164; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010875

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057794548.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794548.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794548.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794548.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794548.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62210906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C12
`Chr2:62210934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B102,C84
`Chr2:62211006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:62211033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:62211044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:62213203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:62213483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:62213513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:62213519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr2:62213580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr2:62213803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:62214106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794548.1

532 aa

266

532

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 107-289 aa PF00026 Asp 107-446 aa PF14541 TAXi_C 331-448 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794548.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	107	289	9.6e-38	130.8	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057794548.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	107	446	1.6e-22	81.1	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057794548.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	331	448	2.7e-17	63.7	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938565.1
TTAGTCCAAGAAAAGAATGAACTCTCCACACTACTGAAAAACTCTTCATGTAAGCACATTTATGCACATCAATCCAAACTTCTTCTGCTCATCCCAACCACTTTACCTTTACCATTTCCCCCCCACAAGAAGCTGCAGGTGAAAAAAAGAGGGAATTCCCACCTGCATTTCATCTCCTGTTTTCGGGCAATTCTCCATGGGGAAAACCAGCTTTTTCGGTGCAATTTTGGTGGCGGTTCTCGCCGTCGATGCGTATTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010875
ATGGGGAAAACCAGCTTTTTCGGTGCAATTTTGGTGGCGGTTCTCGCCGTCGATGCGTATTTTGCTGCGGCGGCGGCGCCCGTCTACTCCTCGCGCCTGATTCACAGGTTCTCCGACGAGGCCCGGGGCCTGTGGAGAAGCCGCGCGGGCGAGGAGGCGGCGTCGTGGCCGGAGAGAAAGAGCTTGGGGCACATGAGGGTGCTGTTGGAGAGTGATTTGAAGCGGCAGAGATTGAAGCTTGGAGCTCAGAAGCAGCTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794548.1
MGKTSFFGAILVAVLAVDAYFAAAAAPVYSSRLIHRFSDEARGLWRSRAGEEAASWPERKSLGHMRVLLESDLKRQRLKLGAQKQLVVASQGGDTFNYGNDMGWLHYTWIDIGTPNNSFLVALDTGSDMLWVPCDCVECAPLSLSHYNMLDKELGEYSPSRSNSSKHIPCSHALCEMGPNCESPNGRCPYSVQYLSDDTSSSGFLFEDQLHLASVRGSKQKSSVQAAIVVGCGSKQTGVYLNGIAPDGLMGLGPGDVSVP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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