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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004003`

染色体: Chr02 坐标: 62357810-62367930 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004003`
名称	SmilChr02G004003
描述	exocyst complex component SEC6
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62357810 - 62367930 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010939`
GeneID	`131010939`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010939`
原始查询	`SmilChr02G004003`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	exocyst complex component SEC6
产物	exocyst complex component SEC6
Arabidopsis	`AT1G71820` (SEC6) SEC6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843512] identity=83.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0749500` - identity=83.3; qcov=0.072; evalue=6.01e-16; confidence=weak
GO	GO:0000145 (exocyst); GO:0000149 (SNARE binding); GO:0006887 (exocytosis); GO:0051601 (exocyst localization)
KEGG	-
Pfam	PF06046 (Sec6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010939

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057794632.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057794632.1`
3	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.60000	`XP_057794632.1`
4	Phragmoplast	Phragmoplast	0.60000	`XP_057794632.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057794632.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62358608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:62359574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:62359586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:62360442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B98
`Chr2:62361232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:62361881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:62362340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:62363453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B101,B62,B64,C12
`Chr2:62365858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:62367782`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B85
`Chr2:62367782`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B85
`Chr2:62367785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794632.1

746 aa

373

746

Sec6

PF06046 Sec6 176-698 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794632.1`	Pfam	`PF06046`	Sec6	Repeat	176	698	1.8e-121	407.0	Exocyst complex component Sec6

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096705.1
CCGGTAAAGACCATTATTGACTATTCCATCATTTTTAGAAAATTTCCAACTGAAAAAAAGAAGAATTTTAGTACAGAGCTCCGATTAATCGGAGGGATCTGAGCTCGGCGGAGCGGTGGGGGAAGATGATGGCGGAGGATCTAGGTGTGGAGGCGAAGGAGGCTGCGGTGCGGGAGGTGGCGAAGTTGCTGTCGCTGCCGGAGCATTTGCTGTCCATCGCTTCGATCAAAGCTGATTACATTTCCCGTCAACAGGCAAAT...

XM_057938649.1
TTCTCAACCCGATCCGGTAAAGACCATTATTGACTATTCCATCATTTTTAGAAAATTTCCAACTGAAAAAAAGAAGAATTTTAGTACAGAGCTCCGATTAATCGGAGGGATCTGAGCTCGGCGGAGCGGTGGGGGAAGATGATGGCGGAGGATCTAGGTGTGGAGGCGAAGGAGGCTGCGGTGCGGGAGGTGGCGAAGTTGCTGTCGCTGCCGGAGCATTTGCTGTCCATCGCTTCGATCAAAGCTGATTACATTTCCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010939
ATGATGGCGGAGGATCTAGGTGTGGAGGCGAAGGAGGCTGCGGTGCGGGAGGTGGCGAAGTTGCTGTCGCTGCCGGAGCATTTGCTGTCCATCGCTTCGATCAAAGCTGATTACATTTCCCGTCAACAGGCAAATGATGCTCAACTCAGTACTATGGTTATCGAACAGGTTGAGCAGGCACAAGAAGGTCTTGAGTCACTGTCCTTGTCTGAAACAACAATAAGTCTTCTCAGAGAAAATTTTGTTGAGATTGAAAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794632.1
MMAEDLGVEAKEAAVREVAKLLSLPEHLLSIASIKADYISRQQANDAQLSTMVIEQVEQAQEGLESLSLSETTISLLRENFVEIEKLCQECQTLIDNHDQIKLLSNARNNLNTTLKDVEGMMSISVEASEAHDSLSDDKELINTYERLTALDGKRRFALAAASSHEEEIGRLREYFEDIDRTWETFEKTLWGHICNFFQLAKDSPQTLVRALRVVEMQETLDQQLATEAAEAEGDGALESIANPRRIAKNLAQKKLKIQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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