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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004013`

染色体: Chr02 坐标: 62438878-62439675 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004013`
名称	SmilChr02G004013
描述	uncharacterized oxidoreductase At4g09670-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62438878 - 62439675 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009854`
GeneID	`131009854`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009854`
原始查询	`SmilChr02G004013`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826553]; symbol=AT4G09670; hit=AT4G09670; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826553]; symbol=AT4G09670; hit=AT4G09670; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G09670` (AT4G09670) Oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826553] identity=56.6; qcov=0.921; evalue=1.34e-49; confidence=medium
Rice	`Os10g0403700` (Ord) - identity=64.6; qcov=0.929; evalue=1.18e-39; confidence=medium
GO	GO:0000166 (nucleotide binding)
KEGG	-
Pfam	PF01408 (GFO_IDH_MocA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009854

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057793242.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793242.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793242.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793242.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793242.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62439028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B37,D7
`Chr2:62439036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:62439037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B57,B88,C51
`Chr2:62439079`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A18
`Chr2:62439079`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A18
`Chr2:62439101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D7
`Chr2:62439105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B8,C36,C77
`Chr2:62439147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr2:62439156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B40,C53,C78
`Chr2:62439165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,C36,C77
`Chr2:62439174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D7
`Chr2:62439188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793242.1

140 aa

140

GFO_IDH_MocA

PF01408 GFO_IDH_MocA 13-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793242.1`	Pfam	`PF01408`	GFO_IDH_MocA	Domain	13	119	1.1e-19	72.0	Oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937259.1
ATGCAACAAAAAAAAAAAGACTTTATCATAGCGCGCAAGATGTCGCGCGCCATCCTCCTCTCCGGCAACTCCACAATCGTCGCCGTAGGCAGCCGCTCCGCCGCTAAGGCCGCCGCGTTCGCCGATGAAAACGGCTTCCCCGCCGCCGCCAGGGCGTACGGGTCGTACGACGCCGTGCTGGACGACGCTGATGTGGACGCCGTGTACATACCGCTGCCGACGAGCCTGCACCGCCACTGGGCCGTGGCGGCGGCGTGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009854
ATGCAACAAAAAAAAAAAGACTTTATCATAGCGCGCAAGATGTCGCGCGCCATCCTCCTCTCCGGCAACTCCACAATCGTCGCCGTAGGCAGCCGCTCCGCCGCTAAGGCCGCCGCGTTCGCCGATGAAAACGGCTTCCCCGCCGCCGCCAGGGCGTACGGGTCGTACGACGCCGTGCTGGACGACGCTGATGTGGACGCCGTGTACATACCGCTGCCGACGAGCCTGCACCGCCACTGGGCCGTGGCGGCGGCGTGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793242.1
MQQKKKDFIIARKMSRAILLSGNSTIVAVGSRSAAKAAAFADENGFPAAARAYGSYDAVLDDADVDAVYIPLPTSLHRHWAVAAAWKGKHVLLEKPVALCTAELDEILATCESSGVQYMDATMWMHHPRTAKMEAFLTSN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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