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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004039`

染色体: Chr02 坐标: 62706465-62708438 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004039`
名称	SmilChr02G004039
描述	probable flavin-containing monooxygenase 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62706465 - 62708438 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010972`
GeneID	`131010972`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010972`
原始查询	`SmilChr02G004039`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable flavin-containing monooxygenase 1
产物	probable flavin-containing monooxygenase 1
Arabidopsis	`AT1G19250` (FMO1) flavin-dependent monooxygenase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838508] identity=35.8; qcov=1.02; evalue=1.52e-101; confidence=medium
Rice	`Os09g0548700` - identity=46.5; qcov=1.04; evalue=1.5e-165; confidence=high
GO	GO:0004499 (N,N-dimethylaniline monooxygenase activity); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding); GO:0050661 (NADP binding)
KEGG	smil00430 (Taurine and hypotaurine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00743 (FMO-like); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010972

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057794674.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794674.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794674.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794674.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794674.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62706556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B57,C67
`Chr2:62706959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:62707046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B57,B9
`Chr2:62707088`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B107,B140,B47,C60
`Chr2:62707088`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B107,B140,B47,C60
`Chr2:62707210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:62707229`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	26	A14,A2,A9,B107,B113,B132,B134,B137,B20,B32,B42,B43,B5,B57,B60,B8,C15,C18,C2,C22,C24,C26,C4,C46,C82,D10
`Chr2:62707334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C49,C5
`Chr2:62707353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C11
`Chr2:62707901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794674.1

510 aa

255

510

FMO-like

NAD_binding_8

PF00743 FMO-like 9-489 aa PF13450 NAD_binding_8 14-52 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794674.1`	Pfam	`PF00743`	FMO-like	Family	9	489	1.6e-38	133.2	Flavin-binding monooxygenase-like
`XP_057794674.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	14	52	1.4e-07	32.4	NAD(P)-binding Rossmann-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938691.1
TTAAATTTGTCATTGACCTTTTGCAAAGTGTCAATCTGCAAGTACAGATGCAGAACAGAAATGAAACTTAGCACATTAATTTCTGCAGAAAAACCATTAATAATAAATTGAAGCAGAATCACATGCAGTGAAGCAAGTTGAGTGGCGGAACGTGCATCATGGATTCTGGAATGCGGAAAGAGGCGAAGAAGGTAGCGATCATCGGCGCAGGAATCAGCGGCATTGTTGCGTGCAAGCATGCTGTGGAGAAGGGGTTTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010972
ATGGATTCTGGAATGCGGAAAGAGGCGAAGAAGGTAGCGATCATCGGCGCAGGAATCAGCGGCATTGTTGCGTGCAAGCATGCTGTGGAGAAGGGGTTTGATCCCATAGTTTTTGAGGCAAGGAGCTGCATTGGAGGGGTGTGGTCCTCCACCATTCATTCCACCAAGCTGCAGACTCCCAAGGATTACTTCCAGTTTTCGGATTTCCCATGGCCCGATTTCGTGTTGGAAGATTTTCCTCATCATAAGCAGGTGTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794674.1
MDSGMRKEAKKVAIIGAGISGIVACKHAVEKGFDPIVFEARSCIGGVWSSTIHSTKLQTPKDYFQFSDFPWPDFVLEDFPHHKQVLEYVRSYALHFEVVPRISFGSKVTALHYSDAAADWTSGQPFSSTGKWSLVVQDVLHPLHPPKVYEMDFVILCIGKFSDLPNIPDFSSRASFNGEVLHTMNYAAMDKMQAAKFTQYKRVTVVGFQKSAVDTAAEIARNNGAKHPCTLVFRRVHWCGSETLVKFTFKNLTRFSQLMV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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