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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004058`

染色体: Chr02 坐标: 62882184-62884923 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004058`
名称	SmilChr02G004058
描述	uncharacterized protein At5g43822-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62882184 - 62884923 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010988`
GeneID	`131010988`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010988`
原始查询	`SmilChr02G004058`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922354]; symbol=AT5G43822; hit=AT5G43822; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922354]; symbol=AT5G43822; hit=AT5G43822; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G43822` (AT5G43822) Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922354] identity=44.5; qcov=0.89; evalue=4.03e-33; confidence=medium
Rice	`Os10g0566900` (OSJNBa0057L21.18) - identity=50.4; qcov=0.701; evalue=1.7e-30; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF15011 (CA109-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010988

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794699.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057794698.1`
3	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057794699.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057794700.1`
5	Spindle	Spindle	0.20000	`XP_057794698.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62882600`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A11,A15,A18,A3,A4,B125,B126,B14,B24,B33,B52,B73,B74,B75,B81,B9,C16,C2,C20,C22,C26,C29,C32,C4,C42,C48,C5,C68,C86,C87,D4
`Chr2:62884083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794698.1

199 aa

100

199

CA109-like

PF15011 CA109-like 3-198 aa

XP_057794699.1

172 aa

172

CA109-like

PF15011 CA109-like 3-155 aa

XP_057794700.1

164 aa

164

CA109-like

PF15011 CA109-like 49-163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794698.1`	Pfam	`PF15011`	CA109-like	Domain	3	198	1.5e-58	198.3	Ribosome biogenesis protein C1orf109-like
`XP_057794699.1`	Pfam	`PF15011`	CA109-like	Domain	3	155	9.8e-48	163.1	Ribosome biogenesis protein C1orf109-like
`XP_057794700.1`	Pfam	`PF15011`	CA109-like	Domain	49	163	2.7e-28	99.7	Ribosome biogenesis protein C1orf109-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938715.1
GAATTCAAAATTCCACATTTAAATAAGTTCTTCATTGTTGTTGGCAACAACTCCGCTCAACTTGAATTTTTTATGCTTTAAATATAGTAGGCTAGTAGCTGTAGACAAGACAGTATTCTATAATATATACGTACATATTATGTGTGTGTGTGTTTTTTTTGTTGCATCTAATGATAATTTGATATACAAATAATGTTTAGTATTCTTATTAAAAATAACACTTAGTTTTGATGTTTGTCACGGATTGGGTGTAGGAGTTA...

XM_057938716.1
TCTATAATATATACGTACATATTATGTGTGTGTGTGTTTTTTTTGTTGCATCTAATGATAATTTGATATACAAATAATGTTTAGTATTCTTATTAAAAATAACACTTAGTTTTGATGTTTGTCACGGATTGGGTGTAGGAGTTAATAGTACATGAAATGAAATGATGCTTCTATTCCCGCTACAACCATTATCGGCCACTGCCCTTCGCGACGCCGCCACCGTCTAGTTTCTCCAGCCGAAAAGCTAACAAATCTTCCTA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131010988
ATGGACTCAATAGTGAAAAAATATCAGCAACGATTTCAGAAAATTAGGGAGGAGATGAACCGGTGGGAAGAGCTCCAGTCTCAGCTGATTTCCCAATTCTCTAATGCATCTTCCATCATCCAGAGGTTGCAGGTTATCCGAGATTCGCAAAACTATGGAGCTTTGAGATGTGTGGAGGGCATAGAAAGTGTTTTGTTGGCAAAACAGATGGATTCCCTCCAAATCATCTTCGTCTCCATCAACAACACTATGAAAGAATT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057794698.1
MDSIVKKYQQRFQKIREEMNRWEELQSQLISQFSNASSIIQRLQVIRDSQNYGALRCVEGIESVLLAKQMDSLQIIFVSINNTMKEFCGIVSYLEKVVCDSKQLVKVGSAQMTTKQLKQRIGVKPTLADCLEGIRLVEEMHQSEYLLKLSVVSALPSIALKPSASGDLGALHQLLVDQPNIPREEVQYIYDIIFAENIS

XP_057794699.1
MDSIVKKYQQRFQKIREEMNRWEELQSQLISQFSNASSIIQRLQVIRDSQNYGALRCVEGIESVLLAKQMDSLQIIFVSINNTMKEFCGIVSYLEKVVCDSKQLVKVGSAQMTTKQLKQRIGVKPTLADCLEGIRLVEEMHQSEYLLKLSVVSALPSIALKPSAIHIRHHIC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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