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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004073`

染色体: Chr02 坐标: 63016353-63020836 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004073`
名称	SmilChr02G004073
描述	protein S-acyltransferase 21
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63016353 - 63020836 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011005`
GeneID	`131011005`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011005`
原始查询	`SmilChr02G004073`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein S-acyltransferase 21
产物	protein S-acyltransferase 21
Arabidopsis	`AT2G33640` (AT2G33640) DHHC-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817930] identity=53.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0585100` - identity=58.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006612 (protein targeting to membrane); GO:0018230 (peptidyl-L-cysteine S-palmitoylation); GO:0019706 (protein-cysteine S-palmitoyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01529 (DHHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011005

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057794721.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057794721.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057794721.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794721.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794721.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63018654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:63018833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:63020015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C35
`Chr2:63020023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:63020102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B99,C35
`Chr2:63020199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:63020234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:63020300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:63020444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr2:63020546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B19,C47
`Chr2:63020582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B99,C35
`Chr2:63020606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794721.1

637 aa

318

637

DHHC

PF01529 DHHC 150-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794721.1`	Pfam	`PF01529`	DHHC	Family	150	286	3.6e-33	115.1	DHHC palmitoyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938738.1
ATTCAAATGAAGAAATTGGAGTTGCCGGAGTTAATTAAGCAGTCAATATATTTTTACTAGTAGAAGACTGAAAACAATATCCATTTTCTATTTTCTTTTATATTTCTTCAGCTCATTACCCTCAAAAAAAAAAAAATACAGATGGCTCATTGATCGATAAATCGAAATGCAGAAGCCCTAGATTTCTGAGCAAAAAAATAACTGAATGGGTCGTGTCAAAATGAGTTTTTTGCATCTATTTGGGTCAGCATTAAAATCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011005
ATGGCGAGGCGTCATGGGTGGCAACTCCCTGCTCACTCCTTTCAGGTTGTGGCAATAACAGTTTTTTTCCTATTATCTGTTGCTTTCTACGCTTTTTTCGCTCCTTTTTTGGGAAAGGAAATCTATGAGTACATTGCTATAGGCATCTATTCTTCCCTGGCACTCTCTGTATTTATACTTTATGTGCGATGTACGGGTATTGACCCCGCCGATCCTGGAATTCTCATTGAAGCAGACAAGATGTCGGCGTACACATCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794721.1
MARRHGWQLPAHSFQVVAITVFFLLSVAFYAFFAPFLGKEIYEYIAIGIYSSLALSVFILYVRCTGIDPADPGILIEADKMSAYTSHVGTELTGTLSATEEPGKFGLKNGGASYEHDSGRCLNVGCCLCYCLVKEDCRKDENYLLEQNSEEALFCTLCNAEVRKFSKHCRSCDKCVDGFDHHCRWLNNCVGRKNYISFVCLMAASLAWLVFECAVGIAVLVRCFVDRKATENAIIDRLGDGFSRPPFATVVALCTAVSLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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