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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004078`

染色体: Chr02 坐标: 63065814-63067344 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004078`
名称	SmilChr02G004078
描述	cysteine protease XCP2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63065814 - 63067344 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011011`
GeneID	`131011011`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011011`
原始查询	`SmilChr02G004078`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine protease XCP2-like
产物	cysteine protease XCP2-like
Arabidopsis	`AT4G35350` (XCP1) xylem cysteine peptidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829688] identity=70.1; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0971400` - identity=68.4; qcov=0.957; evalue=5.61e-167; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0005615 (GO:0005615); GO:0005764 (lysosome); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	-
Pfam	PF00112 (Peptidase_C1); PF08246 (Inhibitor_I29)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011011

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057794729.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794729.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794729.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794729.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63065976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr2:63066008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:63066069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr2:63066285`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B25
`Chr2:63066285`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B25
`Chr2:63066584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr2:63066593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:63066875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr2:63066888`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C36,C77
`Chr2:63066888`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C36,C77
`Chr2:63067251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794729.1

350 aa

175

350

Inhibitor_I29

Peptidase_C1

PF08246 Inhibitor_I29 49-105 aa PF00112 Peptidase_C1 132-346 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794729.1`	Pfam	`PF08246`	Inhibitor_I29	Domain	49	105	1.1e-19	71.2	Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)
`XP_057794729.1`	Pfam	`PF00112`	Peptidase_C1	Domain	132	346	1e-83	281.5	Papain family cysteine protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938746.1
AATTTCTCAAGAATCTCCATTGTTTTTGCATCATATTCCCATTCATCAAAAAACCAATATCTCTTCCATTGTATTTGTAGCCACAAAACATGGCTATCTCTCTATGTTCCAAGCTATTTATTCTAGCAGCGTTGGCGCTGTTGTACACAAGCACCACAACGTATGCACGGGAGCTCTCAATCGTGGGGTACGCGCCCGAGGATCTAACGTGCATCGACAAGCTCATCAATCTCTTCGAATCTTGGGTGGACAAGCATGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011011
ATGGCTATCTCTCTATGTTCCAAGCTATTTATTCTAGCAGCGTTGGCGCTGTTGTACACAAGCACCACAACGTATGCACGGGAGCTCTCAATCGTGGGGTACGCGCCCGAGGATCTAACGTGCATCGACAAGCTCATCAATCTCTTCGAATCTTGGGTGGACAAGCATGGCAAGATGTACAAAACCCTAGAAGAGAAGCTGCACAGGTTTGAGATCTTTAAGGATAATTTGAAGCACATTGATGAGAGGAATAAGGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794729.1
MAISLCSKLFILAALALLYTSTTTYARELSIVGYAPEDLTCIDKLINLFESWVDKHGKMYKTLEEKLHRFEIFKDNLKHIDERNKAVSNYWLGLNEFSDLSHDEFKKMFLGLKSDGIPKRDENFKYRDFVDLPKSVDWRKKGAVTRVKNQGQCGSCWAFSTVAAVEGINQIVTGNLTELSEQELIDCDTAYNNGCNGGLMDYAFSFIVSNNGLHKEDDYPYLMEEGTCQESRDEAEVVTIDGYHDVPANDEKSLLKALAN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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