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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004080`

染色体: Chr02 坐标: 63078308-63081348 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004080`
名称	SmilChr02G004080
描述	protein PLASTID MOVEMENT IMPAIRED 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63078308 - 63081348 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011012`
GeneID	`131011012`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011012`
原始查询	`SmilChr02G004080`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PLASTID MOVEMENT IMPAIRED 1
产物	protein PLASTID MOVEMENT IMPAIRED 1
Arabidopsis	`AT1G42550` (PMI1) plastid movement impaired1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840860] identity=53.1; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0553900` - identity=48.4; qcov=1.07; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10358 (NT-C2); PF21745 (PMI1_PMIR1-2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011012

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057794730.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057794730.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794730.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794730.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794730.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63078704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:63078731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C21
`Chr2:63079289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr2:63079407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr2:63079601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr2:63079715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr2:63079878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B50,C23
`Chr2:63080048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:63080055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:63080161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B20,B34,C16
`Chr2:63080181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B7
`Chr2:63080212`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794730.1

831 aa

416

831

NT-C2

PMI1_PMIR1-2_C

PF10358 NT-C2 119-269 aa PF21745 PMI1_PMIR1-2_C 531-678 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794730.1`	Pfam	`PF10358`	NT-C2	Domain	119	269	1.9e-13	51.0	N-terminal C2 in EEIG1 and EHBP1 proteins
`XP_057794730.1`	Pfam	`PF21745`	PMI1_PMIR1-2_C	Domain	531	678	3.3e-50	171.3	PMI1/PMIR1-2, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938747.1
GGGTGGAGTAAAATTGAGTGGGTTGATTGGTTTTGGCAGTAGATAGCAAAAAGAAACAAGCTCTCCAAATCAATGAAAGCTTGCAATAAATTGTGTGATCTAGTAATTTCGAAAGCATGTGAGAAACACAGCATGTCAACGTTGAACCCTTATCCTTCACACATACAACCAAATCCAATTTCTGGCTCACAGACAAGCATCAACTTATCATCACACACCCAAAAACGAAAGCAAAACAAAACACAGAGCCACTTGAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011012
ATGGCGGCAGAGTATCCAAATTCAAGAAAGTCCAACACTCAAATCCTCCAAGAGCTGGAGGACCTGAGCGACTCCCTGTACCAGAGTCACGTGACATCCACAACAACACGGAGGACCGCCTCCCTCGTGCTCCCCCGGGAGGCCGTCCCCCCGATCGATAAGGATGGCCTCAACCTCAACCCGAAGCCCCGGTCGAGGCGGATGTCCCTGTCTCCGTGGCGGTCTAGGCCCAAGATGGACACAGAGGACGTCCGCCCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794730.1
MAAEYPNSRKSNTQILQELEDLSDSLYQSHVTSTTTRRTASLVLPREAVPPIDKDGLNLNPKPRSRRMSLSPWRSRPKMDTEDVRPKDPVAKPLFSDTPTEKKGIWKWKPIRALTHIGMQKLSCLFSVEVVAVQGLPASMNGLRLSVCVRKKDSREGGVQTMPSRVSQGAADFEETLFIRSHVYYTPPTGSGTHMKFEPRPFLIYVAAVDADELDFGKKTVDLSGLIQESIEKNFQGTRIRQWDTTFSLSGKAKGGELVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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