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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004086`

染色体: Chr02 坐标: 63135536-63136392 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004086`
名称	SmilChr02G004086
描述	RING-H2 finger protein ATL80-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63135536 - 63136392 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011015`
GeneID	`131011015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011015`
原始查询	`SmilChr02G004086`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL80-like
产物	RING-H2 finger protein ATL80-like
Arabidopsis	`AT1G20823` (AT1G20823) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838674] identity=66; qcov=0.879; evalue=1.53e-67; confidence=high
Rice	`Os02g0686100` - identity=53.9; qcov=0.897; evalue=1.47e-43; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF12861 (zf-ANAPC11); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057794733.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794733.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794733.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794733.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794733.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63136006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B80,B84,C24
`Chr2:63136039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A10,B93,C2
`Chr2:63136057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B40,C8
`Chr2:63136192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:63136197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794733.1

174 aa

174

zf-RING_11

zf-RING_2

zf-C3HC4

zf-C3HC4_2

zf-ANAPC11

PF17123 zf-RING_11 108-137 aa PF13639 zf-RING_2 108-151 aa PF00097 zf-C3HC4 109-150 aa PF13923 zf-C3HC4_2 109-150 aa PF12861 zf-ANAPC11 124-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794733.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	108	137	3.6e-12	46.5	RING-like zinc finger
`XP_057794733.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	108	151	2.2e-15	57.3	Ring finger domain
`XP_057794733.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	109	150	1.8e-06	28.4	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057794733.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	109	150	4e-09	36.8	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057794733.1`	Pfam	`PF12861`	zf-ANAPC11	Domain	124	157	3.8e-06	27.6	Anaphase-promoting complex subunit 11 RING-H2 finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938750.1
TTCCCACTTCAAAATGTTTGTTAAACAATAAATAAACTACAAAAACCATCGATACCCAAACATACGTTTCAGCTTAAGCTTACTAAAATTTACTCAAAACACACTCTTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGCGCACTTTCTCTATCTACATGACCGCTCGTTCACGGGAGCTCGGCGGCGTAACCTCACCGCCGTCGCCGTCCAAAAACCCCTCGCCGCCCGTGGAGACTCTCGACTCCGACTTCGTAGTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011015
ATGACCGCTCGTTCACGGGAGCTCGGCGGCGTAACCTCACCGCCGTCGCCGTCCAAAAACCCCTCGCCGCCCGTGGAGACTCTCGACTCCGACTTCGTAGTGATCCTCGCGGCTCTCCTCTGCGCCCTAATCTGCGTGCTCGGCCTCGTCGCTGTCGCGCGCTGCGCCTGGATCCGCCGCCTATCGGGGAGGGCGGCGGCGCCCGCGCAGCCGACGGCGCCGCGACGGTCGACCGCCAACAAAGGCCTGAAGAAGAAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794733.1
MTARSRELGGVTSPPSPSKNPSPPVETLDSDFVVILAALLCALICVLGLVAVARCAWIRRLSGRAAAPAQPTAPRRSTANKGLKKKVLKSLPKLTYGEDPEQTGKLSDCAICLAEFAAGEEIRVLPQCGHGFHVGCIDTWLGSHSSCPSCRQILVVARCQKCGNLPAAAEGGRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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