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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004091`

染色体: Chr02 坐标: 63178134-63178970 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004091`
名称	SmilChr02G004091
描述	uncharacterized SmilChr02G004091
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63178134 - 63178970 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009869`
GeneID	`131009869`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009869`
原始查询	`SmilChr02G004091`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922]; symbol=AT3G47680; hit=AT3G47680; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922]; symbol=AT3G47680; hit=AT3G47680; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=35.6; qcov=0.536; evalue=3.22e-20; confidence=low
Rice	`Os06g0521000` - identity=32.5; qcov=0.608; evalue=2.34e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009869

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793255.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793255.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793255.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793255.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793255.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63178136`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B96
`Chr2:63178136`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B96
`Chr2:63178144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B78
`Chr2:63178154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A20,A6,A8,B101,B109,B110,B121,B131,B140,B18,B19,B25,B33,B47,B51,B52,B59,B60,B62,B63,B69,B73,B77,B83,B86,B99,C10,C22,C24,C3,C35,C36,C39,C41,C6,C75,C82,C84,D4,D8
`Chr2:63178161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B78,C33,C61
`Chr2:63178171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,C6,C80
`Chr2:63178179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	32	A1,A10,A20,A4,A5,B118,B17,B22,B23,B24,B27,B34,B4,B55,B59,B65,B84,C14,C15,C23,C24,C28,C55,C56,C57,C83,C84,C85,C9,D11,D8,D9
`Chr2:63178184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A5,B101,B137,B140,B28,B35,B59,B62,B71,B77,B89,B94,B98,B99,C14,C3,C34,C35,C39,C40,C45,C47,C66,C71,C82
`Chr2:63178193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B126,B34,B97,C73
`Chr2:63178200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr2:63178220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr2:63178226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A11,B105,C34,C65,C74,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937272.1
ATGGCGGATTCTAGCTCCCAAAATTCCGATTCTAGTAATTCAAGCTCTCAAAATATTCAAGGTTCCTATTTTCCAAGTTCACAATACCATCACATGTCCTACCCTCAACAACAATTTCCATACAACTACCAAATGTCTTCGAATTTTCCCCAACAATTTCCATTCAACTCTCCTGGTGGTTCAAATTTTCCTCAACAATTTCCATTCAACTCTCCTACTGGATCAAGCTTTCATCCACAATTTTCATCCAATTTTCCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009869
ATGGCGGATTCTAGCTCCCAAAATTCCGATTCTAGTAATTCAAGCTCTCAAAATATTCAAGGTTCCTATTTTCCAAGTTCACAATACCATCACATGTCCTACCCTCAACAACAATTTCCATACAACTACCAAATGTCTTCGAATTTTCCCCAACAATTTCCATTCAACTCTCCTGGTGGTTCAAATTTTCCTCAACAATTTCCATTCAACTCTCCTACTGGATCAAGCTTTCATCCACAATTTTCATCCAATTTTCCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793255.1
MADSSSQNSDSSNSSSQNIQGSYFPSSQYHHMSYPQQQFPYNYQMSSNFPQQFPFNSPGGSNFPQQFPFNSPTGSSFHPQFSSNFPSTYFMPPPNQFQENNSQFPQHSSQIPVVDDDVEEVGKSTAKTKETKAAWSPDEDILLVKAWYNTSTDSIIGNQQKRKDFWEKITAYYNEWKPEGTAARSLSQVKNHYYRLNPDLNKWAGIYNNFWSNRASGQGDDDVLEAKNATESSEKGHRILRKRPKILKQTVHLLRTLELE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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