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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004098`

染色体: Chr02 坐标: 63295576-63297600 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004098`
名称	SmilChr02G004098
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 27-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63295576 - 63297600 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011028`
GeneID	`131011028`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011028`
原始查询	`SmilChr02G004098`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 27-like
产物	AT-hook motif nuclear-localized protein 27-like
Arabidopsis	`AT1G76500` (SOB3) Putative AT-hook DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843983] identity=63; qcov=0.785; evalue=4.71e-77; confidence=high
Rice	`Os02g0713700` - identity=71.8; qcov=0.618; evalue=5.44e-70; confidence=high
GO	GO:0003680 (minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0010228 (vegetative to reproductive phase transition of meristem)
KEGG	-
Pfam	PF03479 (PCC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011028

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794746.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794746.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794746.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794746.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794746.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63296290`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B85
`Chr2:63296290`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B85
`Chr2:63296362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B131,B57,B9,C67
`Chr2:63296533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:63296665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:63296743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:63296788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C47
`Chr2:63296798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr2:63296861`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A6
`Chr2:63296861`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A6
`Chr2:63296863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr2:63296872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,A10,B28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794746.1

293 aa

146

293

PCC

PF03479 PCC 73-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794746.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	73	192	1.2e-30	106.8	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938763.1
TTTCTTTTTCTCCTTTTATTAATTCTATCCCACTTCTCATAGTATTTGTATTTCTACCTGATCTCCACCGCCCCTCTCTCTCTTTAGGTTTCTCTCACTTCACCGCAAAGTATCTCCTCTGATATTGCTTTGCCCAGACTTCATCCAAGTCTGCCTGAATAAGGGTTTTATTATCATATAAATTATTACATATGTTTGAACTTTTTGTCAATCTCTCTCATACAAGTTGTAGTGGAAAAAATTGGAGCTATATATGACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011028
ATGGCGGGATACGACTCCGGTTCATCTCGCTACGTTCATCAGCTTCTGACAAACCCTACTTCAGAAATGGAGCCTTCAGCAGATTCCAAGGAATCCCCACAGGATAAGGATCAGGAAACCGCCGCCACCACCAGCTCCGGGGGCACCAACCGGCGCCCCCGGGGGCGGCCCCCTGGCTCCAAGAACAAGCCCAAGCCGCCGATCATAGTCACGCGCGACAGCCCCAATGCGCTGCGCTCCCACGTGCTCGAGGTCTCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794746.1
MAGYDSGSSRYVHQLLTNPTSEMEPSADSKESPQDKDQETAATTSSGGTNRRPRGRPPGSKNKPKPPIIVTRDSPNALRSHVLEVSSGTDVVESVSVYARRRGRGVCVLSGGGTVTNVTLRQPGAGAPGAVVTLHGRFEILSLSGTVLPPPAPPGAGGLSIFLSGGQGQVVGGSVVAPLVASGPVVLMAASFANAVFERLPLEEEEGGAPAAAQPQPSASQSSGVTAGGGGRGGHMGESGGGDGGGGDGSFLNSGGGGGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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