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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004099`

染色体: Chr02 坐标: 63302221-63308761 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004099`
名称	SmilChr02G004099
描述	AT-rich interactive domain-containing protein 5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63302221 - 63308761 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011029`
GeneID	`131011029`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011029`
原始查询	`SmilChr02G004099`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT-rich interactive domain-containing protein 5-like
产物	AT-rich interactive domain-containing protein 5-like
Arabidopsis	`AT1G76510` (AT1G76510) ARID/BRIGHT DNA-binding domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843984] identity=70.1; qcov=0.459; evalue=9.66e-146; confidence=medium
Rice	`Os06g0622300` (OsARID3) - identity=63.6; qcov=0.475; evalue=8.49e-142; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF01388 (ARID)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011029

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794747.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794747.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794747.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794747.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794747.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63302533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B103,B127,B54
`Chr2:63305690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C67
`Chr2:63306850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B78,C8
`Chr2:63307320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr2:63307534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:63307596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B78,C8
`Chr2:63307837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794747.1

649 aa

324

649

ARID

PF01388 ARID 354-438 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794747.1`	Pfam	`PF01388`	ARID	Domain	354	438	3e-19	70.0	ARID/BRIGHT DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938764.1
AGGCAACCGCAGAAGCAGGGGCCTTTCTTTGCCGTCCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCCGGCGTTTGAAGGTGCTCTCTCTCTCTACCTCTGCCCTAACGATTTCGCCGTAGCGCAGTTTAAACACACGCAATCGTTGCTTACCTTATAAACAAAAACTCCTCCCCTTCCTAATTATTCCCCCTCCCCCCTTTTAACGATATTTTTGGACTGGAATCTGTGCACGCGCGCAAATTCGCACACTCGCTCCTCGTTTTGCTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011029
ATGGATAGCAAAGATGTAGAAATGGAGGACATCCAAAAGCCTGATTCAGGATATGACATTAAAGAAACCAATGATAAAGTGCTCGACTCTAAGATTGAATTGAAAGACGATGACCTTCCGTCTGCAGTCACTGTTGCAGAGAATGCAAATCAAAGCGAAAATGGTGATGAAGACTTAAATAAGTTGAGTAGTGAAGAAAAGGATCAGATAACTGCCATGAGTGAAATGGAAGCTCAAACTAACCATGAAAGAAAGACTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794747.1
MDSKDVEMEDIQKPDSGYDIKETNDKVLDSKIELKDDDLPSAVTVAENANQSENGDEDLNKLSSEEKDQITAMSEMEAQTNHERKTNEPMSVEGVEPTSEQIDTESKNEEGIEIEANAEVQTASRSIADKLTDVKNDVVEESDAKDGLIEEKPVENDVESAIPVKNVEGDSSGHVAVEKPKNNGETEECVKNVAQIEIADDNVAKIEMAYENVDSGGGSREINKLETGLSSNEAPQVQSVTPVEVPQSVDKEMEDAANAN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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