当前解析结果
SmilChr02G004103| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004103 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004103 |
| 描述 | mogroside IE synthase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 63340346 - 63342290 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011031 |
|---|---|
| GeneID | 131011031 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011031 |
| 原始查询 | SmilChr02G004103 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | mogroside IE synthase-like |
| 产物 | mogroside IE synthase-like |
| Arabidopsis | AT1G05680 (UGT74E2)Uridine diphosphate glycosyltransferase 74E2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837075] identity=42.2; qcov=0.983; evalue=1.64e-124; confidence=medium |
| Rice | Os09g0518200 (OsSGT)- identity=39.6; qcov=0.991; evalue=2.83e-110; confidence=medium |
| GO | GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00201 (UDPGT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011031 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057794751.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057794751.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057794751.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057794751.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057794751.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:63340553 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B40,C53,C78 |
Chr2:63340615 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B42 |
Chr2:63340615 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B42 |
Chr2:63340629 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B47,B80,B81,B84,C24 |
Chr2:63340756 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr2:63340899 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,C17,C61,D1 |
Chr2:63340996 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr2:63341141 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B100,B140 |
Chr2:63341406 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:63341777 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057794751.1PF00201
UDPGT 270-392 aa
XP_057794752.1PF00201
UDPGT 270-392 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057794751.1 |
Pfam | PF00201 |
UDPGT | Family | 270 | 392 | 6e-26 | 92.0 | UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase |
XP_057794752.1 |
Pfam | PF00201 |
UDPGT | Family | 270 | 392 | 6e-26 | 92.0 | UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。