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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004111`

染色体: Chr02 坐标: 63406827-63409082 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004111`
名称	SmilChr02G004111
描述	uncharacterized SmilChr02G004111
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63406827 - 63409082 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009871`
GeneID	`131009871`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009871`
原始查询	`SmilChr02G004111`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43730` (AT1G43730) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840963] identity=25.6; qcov=0.796; evalue=4.34e-11; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=27.4; qcov=0.808; evalue=1.28e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009871

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793258.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057793258.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057793258.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057793258.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793258.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63408059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B111,B17,C13,C53
`Chr2:63408122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr2:63408162`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A6,B115,B121,B124,B128,B13,B130,B135,B2,B31,B49,B5,B60,B75,B78,B98,B99,C25,C28,C3,C45,C58,C62,C78,C80,C81,D5
`Chr2:63408291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:63408478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:63408520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:63408553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr2:63408572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B35,B49
`Chr2:63408572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B49
`Chr2:63408740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr2:63408886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B68
`Chr2:63408974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793258.1

334 aa

167

334

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 140-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793258.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	140	233	4.1e-19	69.7	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937275.1
ATGGACTCCGCTCCGTCCGACCATCCTGAATCCGATTCCAATTCAGATTCTGACTCATCTAAATCCGGTTCTTCGATCAAGGACGAGAGAGGGGTAATCAGGGCAAGTCAAGGGGAAATAGAGAGGGAGGAGGATGAGTTCCGAGTCAAGGGAGGAAGAGGCGGAAGAAGTGGGTGGTGGAAAAAGGTTTTGAGTATAAGTAGGGGGGAGGGAGGAAACTGGTTCAGGGAGAATATGGTTTTACAAGTGGGGGAGGGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009871
ATGGACTCCGCTCCGTCCGACCATCCTGAATCCGATTCCAATTCAGATTCTGACTCATCTAAATCCGGTTCTTCGATCAAGGACGAGAGAGGGGTAATCAGGGCAAGTCAAGGGGAAATAGAGAGGGAGGAGGATGAGTTCCGAGTCAAGGGAGGAAGAGGCGGAAGAAGTGGGTGGTGGAAAAAGGTTTTGAGTATAAGTAGGGGGGAGGGAGGAAACTGGTTCAGGGAGAATATGGTTTTACAAGTGGGGGAGGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793258.1
MDSAPSDHPESDSNSDSDSSKSGSSIKDERGVIRASQGEIEREEDEFRVKGGRGGRSGWWKKVLSISRGEGGNWFRENMVLQVGEGESTRFWKQRWVGERSLEDMFPRLFHLNSNKEGFISEMGGKRDAWKWKADVSGAFSVKTAYKSLSNAARPSIPSSDGFDWHQVWKTPASFKAVLTAWKVLKQRMATCDNLQRRHVPISYSEAMCTLCKSNQESIEHLFFECQRAVEVWNEILVWIGKVAVNHHSAKGHFLAFTNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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