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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004126`

染色体: Chr02 坐标: 63509322-63511553 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004126`
名称	SmilChr02G004126
描述	protein LYK5
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63509322 - 63511553 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011051`
GeneID	`131011051`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011051`
原始查询	`SmilChr02G004126`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LYK5
产物	protein LYK5
Arabidopsis	`AT2G33580` (LYK5) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817923] identity=48.1; qcov=1.09; evalue=6.54e-179; confidence=high
Rice	`Os06g0625200` (OsLysM-RLK6) - identity=41.9; qcov=0.99; evalue=9.8e-123; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF23446 (LysM1_NFP_LYK); PF23472 (LysM2_CERK1_LYK3_4_5); PF23473 (LysM3_LYK4_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011051

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057794781.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794781.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794781.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794781.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794781.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63509515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C35
`Chr2:63509537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B55,B93,C2
`Chr2:63509596`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr2:63509596`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr2:63509810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C12
`Chr2:63509940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr2:63510172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:63510444`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr2:63510444`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr2:63510450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:63510484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:63510760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B19,B28,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794781.1

607 aa

304

607

LysM1_NFP_LYK

LysM2_CERK1_LYK3_4_5

LysM3_LYK4_5

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF23446 LysM1_NFP_LYK 50-106 aa PF23472 LysM2_CERK1_LYK3_4_5 112-167 aa PF23473 LysM3_LYK4_5 182-232 aa PF00069 Pkinase 372-583 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 374-585 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794781.1`	Pfam	`PF23446`	LysM1_NFP_LYK	Domain	50	106	2e-22	80.5	NFP/LYK LysM1 domain
`XP_057794781.1`	Pfam	`PF23472`	LysM2_CERK1_LYK3_4_5	Domain	112	167	4.1e-25	88.2	LYK3/4/5 LysM2 domain
`XP_057794781.1`	Pfam	`PF23473`	LysM3_LYK4_5	Domain	182	232	5.3e-16	59.2	LYK4/5 LysM3 domain
`XP_057794781.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	372	583	9.2e-33	114.5	Protein kinase domain
`XP_057794781.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	374	585	2.9e-37	129.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938798.1
ATGGCGTTTCTTGCTCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTAGCATTTCCGGTGCAATTTGAGGCCCAACAGAGCTACGTAAACAACAAGCAGCTCAAATGTAATGAAAGCCCCAACAACACTCTGGGATTCGTGTGCAACGCTGCCCCCTCTTGCACCTCCTACCTCACCTTCCGATCCACCCCCACCTACAACAGCCCCGCCACCATCGCCTACCTCCTCGCCGCCGACGCCTCCCAGATCGCCACCGCCAACAACATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011051
ATGGCGTTTCTTGCTCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTAGCATTTCCGGTGCAATTTGAGGCCCAACAGAGCTACGTAAACAACAAGCAGCTCAAATGTAATGAAAGCCCCAACAACACTCTGGGATTCGTGTGCAACGCTGCCCCCTCTTGCACCTCCTACCTCACCTTCCGATCCACCCCCACCTACAACAGCCCCGCCACCATCGCCTACCTCCTCGCCGCCGACGCCTCCCAGATCGCCACCGCCAACAACATCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794781.1
MAFLALVLLLLLVAFPVQFEAQQSYVNNKQLKCNESPNNTLGFVCNAAPSCTSYLTFRSTPTYNSPATIAYLLAADASQIATANNISDVAPLPTDTLVLVPVNCSCSGNAYYYQHNASYTLKTPGETYFTVANDTYQSLSTCQSLIAQNPYNLRQLLPNMRLLVPLRCACPTPSQTAAGFNYLLTYLLRQGNDVNFIAAQFAAAGADVQAILHANMLNTSIVFFFTPLLVPLKIQPTKENINTAPSPPPPPPPSVLPNPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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