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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004143`

染色体: Chr02 坐标: 63761396-63763607 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004143`
名称	SmilChr02G004143
描述	endoglucanase 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63761396 - 63763607 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011068`
GeneID	`131011068`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011068`
原始查询	`SmilChr02G004143`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endoglucanase 2-like
产物	endoglucanase 2-like
Arabidopsis	`AT1G19940` (GH9B5) glycosyl hydrolase 9B5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838583] identity=67.8; qcov=0.886; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0533900` (OsGH9B5) - identity=57.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00759 (Glyco_hydro_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011068

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057794804.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794804.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794804.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794804.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794804.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63761700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C25,D11
`Chr2:63761711`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr2:63761711`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr2:63761724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,C44,C74
`Chr2:63762006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B140,C12
`Chr2:63762273`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B138
`Chr2:63762273`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B138
`Chr2:63762408`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	112	A1,A10,A11,A13,A14,A16,A20,A25,A6,A7,A8,B100,B103,B104,B106,B107,B108,B109,B11,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B126,B128,B131,B132,B133,B14,B140,B15,B16,B2,B20,B21,B26,B27,B28,B3,B36,B37,B39,B4,B47,B49,B50,B52,B53,B55,B60,B61,B65,B66,B69,B72,B74,B75,B79,B81,B82,B83,B85,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,C11,C14,C15,C2,C20,C24,C25,C27,C33,C35,C36,C37,C4,C42,C43,C45,C47,C49,C50,C52,C54,C56,C57,C59,C70,C71,C72,C75,C77,C8,C85,C87,C9,D1,D5,D6
`Chr2:63762411`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	110	A1,A10,A11,A13,A14,A16,A20,A25,A6,A7,A8,B100,B103,B104,B106,B107,B108,B109,B11,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B126,B128,B131,B132,B133,B14,B140,B15,B16,B2,B20,B21,B26,B27,B28,B3,B36,B37,B39,B4,B47,B49,B52,B53,B55,B60,B61,B65,B66,B69,B72,B74,B75,B78,B79,B81,B82,B83,B85,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,C11,C14,C15,C2,C24,C25,C27,C33,C35,C36,C37,C4,C42,C43,C47,C49,C50,C52,C54,C56,C57,C59,C70,C71,C72,C75,C77,C8,C85,C87,C9,D1,D5,D6
`Chr2:63762506`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A11,C72
`Chr2:63762506`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A11,C72
`Chr2:63762584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794804.1

519 aa

260

519

Glyco_hydro_9

PF00759 Glyco_hydro_9 51-505 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794804.1`	Pfam	`PF00759`	Glyco_hydro_9	Repeat	51	505	1.6e-148	496.4	Glycosyl hydrolase family 9

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938821.1
ACCCCTTTTCTGTCAGATTTTACTTCACTTCTCTCAAAGCCTAACAAATACTCTTAAATTCTCTCATCCCTAATTTTCCAATAGGTTGCTTATTTCAAAAGTTGTGAATAAATTTCCGAGACTATTTCACATATTTTGGCTCATCGCCATTTCGTGTTCTCTTTGTTTCATCTAATTTGAAGAACTAGTCGATCGCCCCATACTAGGAAAGATCATCATTCAGTTTTATAGAAGAAAGATTTTGATTTGTGATTTTTCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011068
ATGAGGGAGAGGAAAAAGAAATCGGGAGGGTGTTGGGGTTGGTTCTTGTTGTTAATAGTATTAGGAGGCATCGCATTCGCAGTTTTTGTAGTTTTGAGGAACTCAAAATCCAGCTCCGTTTTCGGCTCTACCTTTTCCGTTTCAAAGAAATATGCCGACGCTCTCAAAATCGCATTGCAGTTTTTGGACGTACAAAAATCCGGGAAGTTGGAGGACAATAAGATATCTTGGAGAGGGGATTCAGCTCTGAAAGACGGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794804.1
MRERKKKSGGCWGWFLLLIVLGGIAFAVFVVLRNSKSSSVFGSTFSVSKKYADALKIALQFLDVQKSGKLEDNKISWRGDSALKDGSEAKLNLSMGMYDAGDHIKFGFPMAFTATVLSWAILEYGAQMKLLDQLEPAQNSLKWITDFLINAHPADNLLYIQVGDPKLDHSCWNKPEDMTEPRPLTMVNASAPGTEVAAETAAALASASLVYKSVDSVYSSLLLKHARQLFAFADKYRMSYSISIPQVGTYYNSTGYGDEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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