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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004145`

染色体: Chr02 坐标: 63770923-63774238 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004145`
名称	SmilChr02G004145
描述	protein SPA, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63770923 - 63774238 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011069`
GeneID	`131011069`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011069`
原始查询	`SmilChr02G004145`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SPA, chloroplastic
产物	protein SPA%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G75690` (LQY1) DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843903] identity=71.3; qcov=1; evalue=2e-78; confidence=high
Rice	`Os03g0244000` - identity=69.4; qcov=0.917; evalue=2.46e-69; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF17302 (DUF5351)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011069

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057794805.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057794805.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.60000	`XP_057794805.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057794805.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794805.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63771399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,B91
`Chr2:63771434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C87
`Chr2:63771435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,D1
`Chr2:63771498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C35
`Chr2:63774005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794805.1

157 aa

157

DUF5351

PF17302 DUF5351 101-132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794805.1`	Pfam	`PF17302`	DUF5351	Family	101	132	4.5e-09	37.2	Family of unknown function (DUF5351)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938822.1
AACGAAAATGTTGGTGGAAATTTTGAAGAAAATCCCATTTCCAAAATTTTCCCTGGCGAAGATTGAAGTGAGCCCCACACAATCCACATTCCGCCACTGAAACACCAAGAGATTCTCCTCTCTTTACTCAATTTTGCTGCTACGATTCCACCATTTTCATTCAAGGATTTGCTAAAATTGATAGGGAAAAGGGAAAATGTTAGCTGCACCTTCAGCTTCTCGCCTCAACTCTCCATTTGTCTACTGCCCCCTTAAGCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011069
ATGTTAGCTGCACCTTCAGCTTCTCGCCTCAACTCTCCATTTGTCTACTGCCCCCTTAAGCTTTCCTCTCCATCTTCATTTCCCACAAAATCCCTCAAAACGCAACGCTCTCCGGCTTCGTATCCATGCGTCAGAGCAGTTGATCTTGATCAGAACACAATAGTGGCAATTACAGTTGGGGTGGTCAGTGTTGCAGTCGGGATTGGGATTCCTGTTTTCTATGAGACCCAAATTGACAGTGCTGCCAAGAGAGAAAATAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794805.1
MLAAPSASRLNSPFVYCPLKLSSPSSFPTKSLKTQRSPASYPCVRAVDLDQNTIVAITVGVVSVAVGIGIPVFYETQIDSAAKRENTQACFPCNGSGSQKCRFCTGTGSVSVDLGGDEKEISRCINCDGAGSLTCTTCQGSGIQPRYLDRREFKDDD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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