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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004148`

染色体: Chr02 坐标: 63804244-63808986 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004148`
名称	SmilChr02G004148
描述	transcription factor E2FC-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63804244 - 63808986 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011073`
GeneID	`131011073`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011073`
原始查询	`SmilChr02G004148`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor E2FC-like
产物	transcription factor E2FC-like
Arabidopsis	`AT1G47870` (ATE2F2) winged-helix DNA-binding transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841202] identity=44.5; qcov=0.877; evalue=1.62e-84; confidence=medium
Rice	`Os12g0158800` (Orysa) - identity=46.4; qcov=0.678; evalue=6.12e-74; confidence=high
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity); GO:0090575 (RNA polymerase II transcription regulator complex)
KEGG	-
Pfam	PF02319 (WHD_E2F_TDP); PF16421 (E2F_CC-MB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011073

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794810.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794810.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794810.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794810.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794810.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63804828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C36
`Chr2:63805081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C17,D3
`Chr2:63805382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B140,C12
`Chr2:63805393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:63806144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B50,C23
`Chr2:63806351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:63806639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,D3
`Chr2:63808521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C37
`Chr2:63808571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr2:63808730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794810.1

413 aa

206

413

WHD_E2F_TDP

E2F_CC-MB

PF02319 WHD_E2F_TDP 156-219 aa PF16421 E2F_CC-MB 235-332 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794810.1`	Pfam	`PF02319`	WHD_E2F_TDP	Domain	156	219	5e-28	97.3	E2F/DP family winged-helix DNA-binding domain
`XP_057794810.1`	Pfam	`PF16421`	E2F_CC-MB	Domain	235	332	1e-24	87.2	E2F transcription factor CC-MB domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938827.1
CGAAAATTGAAAAGGGCAATAGGCGGGGGCGGGCCCCTCCGATTCGAACTCACCGCCTCCACTCCCGCTGTTTTACATTCCAAAACCCCCGCCGCTTCGATTCACTGTGTTGGAGTTCGATTTCATGGTATGTCAGCCTCCGGCGAGAATTTGGACCTGAATCTCAGTCTAAATCTACCTCTATCTAGATTGCATTTGGAGAAGCATTCCCTTTCGCAGCAACCGCATCTGAGGCTGCCTTCTCTTTCGCCTCCCGCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011073
ATGTCAGCCTCCGGCGAGAATTTGGACCTGAATCTCAGTCTAAATCTACCTCTATCTAGATTGCATTTGGAGAAGCATTCCCTTTCGCAGCAACCGCATCTGAGGCTGCCTTCTCTTTCGCCTCCCGCTGTCGCCACCACCAACTCCAGCAAAGTCACCCCTGATAAGTTTGATGCTCATTGTAGCGGTGATATGATCGCTCAACGATCGCGCTTCTCGCTTCCACCGTCGCACTTGCTGCCTCGGAACAATACGCCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794810.1
MSASGENLDLNLSLNLPLSRLHLEKHSLSQQPHLRLPSLSPPAVATTNSSKVTPDKFDAHCSGDMIAQRSRFSLPPSHLLPRNNTPNELGSVGVNASLQIPKQEEVVNTFLLGPSSYVVGAKRVSKAKSSKNAKSVVQEAKLESIDNFSLSSCRYDNSLGLLTKKFIKLIQGAKDGTLDLNRTADVLQVQKRRIYDITNVLEGIGLIEKTTKNHIRWKGFEMFGPKEQDDKVSHLKAEVELLRAEDRRLDDCIRQKLEDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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