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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004150`

染色体: Chr02 坐标: 63816830-63822945 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004150`
名称	SmilChr02G004150
描述	uncharacterized SmilChr02G004150
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63816830 - 63822945 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011072`
GeneID	`131011072`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011072`
原始查询	`SmilChr02G004150`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic initiation factor 3 gamma subunit family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819181]; symbol=AT2G45730; hit=AT2G45730; species=arabidopsis; confidence=high
产物	eukaryotic initiation factor 3 gamma subunit family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819181]; symbol=AT2G45730; hit=AT2G45730; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G45730` (AT2G45730) eukaryotic initiation factor 3 gamma subunit family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819181] identity=60.2; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0112300` - identity=52.4; qcov=1.03; evalue=6.65e-160; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0030488 (tRNA methylation); GO:0031515 (tRNA (m1A) methyltransferase complex)
KEGG	-
Pfam	PF04189 (Gcd10p)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011072

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794809.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057794809.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794809.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794809.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794809.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63817778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr2:63817981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C87
`Chr2:63818067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr2:63818206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B140,C12
`Chr2:63818226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:63819810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr2:63819817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,D3
`Chr2:63822472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr2:63822701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B50,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794809.1

454 aa

227

454

Gcd10p

PF04189 Gcd10p 24-287 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794809.1`	Pfam	`PF04189`	Gcd10p	Family	24	287	6.8e-59	200.1	Gcd10p family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938826.1
CCACATTCCGATGAAACGCTGTCGTCAAGCTACATGGCCTACCCCTTTGTTAGGGTTTTAATTTCAAACTTTTGCGCCCAAAATTCCAAAACCCTTAAATCCCACCTGATTTATACTCGGTTCAATTCAAGATTATTCCTTTTTCTGATAAACGAACAATAACCCAAGCAAATCATGTCGACATATAATTCAGACGAAAATTTGAGCGGGAATGCGAACCGTAGAAGCACCTGGGATGGCTGCAGTGTGTTGCTTGACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011072
ATGTCGACATATAATTCAGACGAAAATTTGAGCGGGAATGCGAACCGTAGAAGCACCTGGGATGGCTGCAGTGTGTTGCTTGACATCAACGATGGCGATCGAGTGCTTTTTGCTCGCCTTACTGCAGGCTCGAAAATAAAGATAGGAGACAAGAATTGCTCTCTGCAGCCTTTGATTGGGTGCCCATTTGGGTCTTCGTTTCAGGTGGAAGTTGGCGCAGACGGACCGTTTCTATCTCCGATTGTTCCAAATGGAGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794809.1
MSTYNSDENLSGNANRRSTWDGCSVLLDINDGDRVLFARLTAGSKIKIGDKNCSLQPLIGCPFGSSFQVEVGADGPFLSPIVPNGEGNNLGEKMDDQTMEECRDNRALVDNNTAQSLTGEDIDGMRRKGATGDEIVQALIANSATFEKKTAFSQEKYRIKKQKKYAPRVLLRRPFARSICEAYFKKHAEKIGFLRVDTLSLLLSLANVTAHSDVLVFDMLEGIVTGSVAERMGGTGYVCNPYCGTTPSPISIVRMFNFSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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