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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004161`

染色体: Chr02 坐标: 63935565-63940700 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004161`
名称	SmilChr02G004161
描述	uncharacterized SmilChr02G004161
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63935565 - 63940700 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011085`
GeneID	`131011085`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011085`
原始查询	`SmilChr02G004161`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytomatrix protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838587]; symbol=AT1G19980; hit=AT1G19980; species=arabidopsis; confidence=low
产物	cytomatrix protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838587]; symbol=AT1G19980; hit=AT1G19980; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G19980` (AT1G19980) cytomatrix protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838587] identity=32; qcov=1.08; evalue=9.16e-42; confidence=low
Rice	`Os04g0117200` - identity=26.2; qcov=1.25; evalue=4.32e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011085

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794834.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057794834.1`
3	Centromere	着丝粒	0.40000	`XP_057794834.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057794834.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794834.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63935808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:63935825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B95,C11,C47,C69
`Chr2:63936076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr2:63938227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr2:63938506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C16
`Chr2:63938785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B50,C23
`Chr2:63938799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:63938808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:63938875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096734.1
TTCGATCCAACGTTTTCTCTCTCTCTTTCTTCCTCCTATCTTCTCTTCTCTTTACTACTCTTTTCTGCTACTTCGCTGTGAAACCTAAGTTCCTGCTATATTTTTCTCAATTTGTACTGCTTGAAATTTTACCTTTGTACTCGTATAACTGCATTTTTCTCCAACTTTGCAATGGGGAAACGCAGATCCCCCGAGAAAGATTCCGACCGCGAAAAAAAATGGAATAAGATTTTCAACGCGTTGGTTAAGTTGTCCCAGAA...

XR_009096735.1
TTCGATCCAACGTTTTCTCTCTCTCTTTCTTCCTCCTATCTTCTCTTCTCTTTACTACTCTTTTCTGCTACTTCGCTGTGAAACCTAAGTTCCTGCTATATTTTTCTCAATTTGTACTGCTTGAAATTTTACCTTTGTACTCGTATAACTGCATTTTTCTCCAACTTTGCAATGGGGAAACGCAGATCCCCCGAGAAAGATTCCGACCGCGAAAAAAAATGGAATAAGATTTTCAACGCGTTGGTTAAGTTGTCCCAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011085
ATGGGGAAACGCAGATCCCCCGAGAAAGATTCCGACCGCGAAAAAAAATGGAATAAGATTTTCAACGCGTTGGTTAAGTTGTCCCAGAATCTGCAGAACGAGAGGCAGATTCTTGAAGAAAGAGTTAAATTTTTGCACGAATTTATTTATAAGATGAAAATGGAGCAGAAAGTTGATTCTTTGAAAGCGGAATTCACTCTCGGTTTGAAGGAACGGGAATCTATCGTTTTTAAGCATAGATATGAGAATGCTGAGAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794834.1
MGKRRSPEKDSDREKKWNKIFNALVKLSQNLQNERQILEERVKFLHEFIYKMKMEQKVDSLKAEFTLGLKERESIVFKHRYENAENDMADFREWCDYLVRKFSGLTGESIDISKKGESSRIKALQDEVRKLKNEIEKSKVEKNAEISALMAEKNFIWNQFEQMETSLTEKLRKERDEVKNVKEKFQILVSRADELQISNEKLKANIFTMESESIKKNEEIVKLMKEIETLKSRSGSASTLLRPCRADAASSSRRGKKSST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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