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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004162`

染色体: Chr02 坐标: 63947914-63951511 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004162`
名称	SmilChr02G004162
描述	naringenin,2-oxoglutarate 3-dioxygenase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63947914 - 63951511 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011084`
GeneID	`131011084`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011084`
原始查询	`SmilChr02G004162`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	naringenin,2-oxoglutarate 3-dioxygenase-like
产物	naringenin%2C2-oxoglutarate 3-dioxygenase-like
Arabidopsis	`AT3G51240` (F3H) flavanone 3-hydroxylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824287] identity=74.2; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0662600` (OsF3H-1) - identity=72.6; qcov=0.906; evalue=1.68e-179; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00941 (Flavonoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011084

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794833.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057794833.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794833.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794833.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794833.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63948123`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A10,B100,B124,B13,B32,C25,C48,C83,D7
`Chr2:63948126`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A10,B100,B124,B13,B32,C25,C48,C83,D7
`Chr2:63948165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B103,B127,B54
`Chr2:63949076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr2:63949151`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B22
`Chr2:63949151`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B22
`Chr2:63951249`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A7,B102,B21,B40,C53,C78
`Chr2:63951312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794833.1

351 aa

176

351

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 41-151 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 197-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794833.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	41	151	2.3e-19	70.9	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057794833.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	197	297	5.6e-31	107.6	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938850.1
ACCCACTCGATGTTGAAAGTTAAGTGCCGAGAAAGTTAGGTGCAGACAAAACCACGTTTTCCCTTATAAAAATCATATGAAAATCTTCCAAACTGCTGAAATTATTCATGGCTGCACAAATGAAAATCTGTGTTTGTGAAGAAGCAGAAGCCGGCGCCCTCCACCCCAAATTCATCAGAGATGAAGAAGAGAGGCCTAAGGTGGCCTACGACCAATTCAGCGACGATATACCGGTGATATCTTTCGCCGGAATTGAGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011084
ATGGCTGCACAAATGAAAATCTGTGTTTGTGAAGAAGCAGAAGCCGGCGCCCTCCACCCCAAATTCATCAGAGATGAAGAAGAGAGGCCTAAGGTGGCCTACGACCAATTCAGCGACGATATACCGGTGATATCTTTCGCCGGAATTGAGGAGAGCGGGGAGAAGAGGGCGGAGGCGTGGCGGAGGATCGTGGCGGCGAGTGAGGATTGGGGTATTTTTCAGCTGGTTGATCATGCTGTGGATTTCACGCTGCTTCAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794833.1
MAAQMKICVCEEAEAGALHPKFIRDEEERPKVAYDQFSDDIPVISFAGIEESGEKRAEAWRRIVAASEDWGIFQLVDHAVDFTLLQRMSSLARDFFALPSQEKLRFDMSGGKKGGFIVSSHLQGEVVQDWREIVTYFSYPVAARDYSRWPDKPEGWRAATEEYSRQVMELGCKLLEILSEAMDLEKDALSKACVNMDQKIVVNFYPKCPQPDLTLGLKRHTDPGLITLLLQDQVGGLQATRDDGNTWITIRPIQGAFVVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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