当前解析结果
SmilChr02G004165| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004165 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004165 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G004165 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 63968746 - 63970278 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131011088 |
|---|---|
| GeneID | 131011088 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011088 |
| 原始查询 | SmilChr02G004165 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011088 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057794838.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057794838.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057794838.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057794838.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057794838.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:63969036 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:63969062 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B97 |
Chr2:63969152 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C47 |
Chr2:63969273 |
TCA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 135 | A1,A10,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A3,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B107,B110,B112,B113,B114,B115,B118,B12,B120,B121,B122,B126,B132,B133,B136,B138,B139,B14,B16,B17,B21,B22,B23,B27,B32,B34,B36,B37,B38,B39,B40,B46,B47,B55,B56,B57,B58,B60,B62,B63,B64,B68,B7,B71,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B88,B93,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C17,C18,C19,C2,C20,C23,C24,C29,C30,C31,C33,C35,C36,C39,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C48,C49,C51,C52,C54,C56,C59,C6,C64,C66,C69,C70,C71,C75,C76,C79,C8,C80,C82,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D6,D7,D8,D9 |
Chr2:63969286 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 109 | A1,A10,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A22,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B107,B110,B113,B118,B12,B120,B122,B132,B133,B136,B138,B139,B14,B16,B21,B22,B23,B27,B34,B36,B37,B40,B46,B47,B55,B56,B57,B58,B60,B63,B64,B68,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B88,B93,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C13,C17,C18,C19,C2,C20,C23,C24,C29,C30,C31,C35,C36,C39,C40,C41,C43,C48,C51,C54,C56,C59,C6,C64,C66,C70,C71,C75,C76,C79,C8,C82,C84,C85,C86,C9,D1,D11,D2,D4,D6,D7,D8,D9 |
Chr2:63969537 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B25,C85 |
Chr2:63969867 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B95,C14 |
Chr2:63969882 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B21,B34,C19,C36 |
Chr2:63969893 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B124,C25,C83 |
Chr2:63969982 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr2:63970016 |
G |
GAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C40 |
Chr2:63970016 |
G |
GAT |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | C40 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。