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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004169`

染色体: Chr02 坐标: 63990485-63996553 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004169`
名称	SmilChr02G004169
描述	uncharacterized SmilChr02G004169
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63990485 - 63996553 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011091`
GeneID	`131011091`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011091`
原始查询	`SmilChr02G004169`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0715600; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0715600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G42470` (AT5G42470) BRCA1-A complex subunit BRE-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834254] identity=57.6; qcov=1.01; evalue=1.34e-161; confidence=high
Rice	`Os06g0715600` - identity=57.5; qcov=0.973; evalue=5.43e-162; confidence=high
GO	GO:0006302 (double-strand break repair); GO:0070531 (BRCA1-A complex); GO:0070552 (BRISC complex)
KEGG	smil03440 (Homologous recombination - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06113 (BRE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011091

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794842.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794842.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057794842.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057794842.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794842.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63991289`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B106
`Chr2:63991289`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B106
`Chr2:63996343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,C37,C85,D10
`Chr2:63996366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B55,C13
`Chr2:63996376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C37,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794842.1

372 aa

186

372

BRE

PF06113 BRE 21-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794842.1`	Pfam	`PF06113`	BRE	Family	21	321	1.8e-43	149.4	Brain and reproductive organ-expressed protein (BRE)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938859.1
AAAGTTATTTGGGAAGTAAAGGTGTAGATGAATTTTTTTTTACATAACACGAAGCTCAACCCGTAGCTGTGACGGCCCATTTAAAATGTTTCTTCGTCATCCTTCACTGGTTTGAACCTCAGCTTCTAAGCTTTTCCGCTTAATCACCGGAGCCATGGCGATCGACACCGTACCGCCGCTCATCTCCGCTCAAATCAATTATCTCCTCAGCCACTGCCCTTTCTCCGTCAAGGTTGAGCAAATGTGGTCGGGATGCAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011091
ATGGCGATCGACACCGTACCGCCGCTCATCTCCGCTCAAATCAATTATCTCCTCAGCCACTGCCCTTTCTCCGTCAAGGTTGAGCAAATGTGGTCGGGATGCAAAAGCCCTAACTTTCTTGATCGCTTCACTCTAGTTATCCCGTACTGCCTTGACCATATAAAATGGGATGTTACATTCAATGCTATGTATCCGTTGGCGGCGCCCGATGTGATATTTGGACCTGAAGATGAAAGTTTCCAGCCGTATGTCGGTGGCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794842.1
MAIDTVPPLISAQINYLLSHCPFSVKVEQMWSGCKSPNFLDRFTLVIPYCLDHIKWDVTFNAMYPLAAPDVIFGPEDESFQPYVGGTGKSSKNYLANWNSRDPSQLHSLIVELRDAYMAYQRKRIGEVDDERVKFEISTMLSREGIEMYMSLGTDKPEEVKFAVPLLDMDLNRLVAGSTWRHPQKVYLQVIFPVGKKYSAVPPPPRLKLISSPELKALFSTEDFKLPTWVDGMCTAEYLPNLEQMLNSQIKDAVSSIEIR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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