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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004176`

染色体: Chr02 坐标: 64042824-64044783 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004176`
名称	SmilChr02G004176
描述	thaumatin-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64042824 - 64044783 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011098`
GeneID	`131011098`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011098`
原始查询	`SmilChr02G004176`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thaumatin-like protein 1
产物	thaumatin-like protein 1
Arabidopsis	`AT4G24180` (TLP1) THAUMATIN-LIKE PROTEIN 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828519] identity=65.3; qcov=0.864; evalue=4.61e-124; confidence=high
Rice	`Os09g0536400` - identity=62.5; qcov=0.874; evalue=2.2e-112; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00314 (Thaumatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011098

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057794851.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057794851.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794851.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794851.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794851.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64043018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr2:64043034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A20,B132,B140,B9
`Chr2:64043164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B21,B40,C53,C78
`Chr2:64043870`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C54
`Chr2:64043870`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C54
`Chr2:64043938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:64043945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B82,C1,C30,C71
`Chr2:64043952`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B137,B29,B44,B53,B62,B77,B80,C34
`Chr2:64044030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr2:64044060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr2:64044071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:64044120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794851.1

317 aa

158

317

Thaumatin

PF00314 Thaumatin 35-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794851.1`	Pfam	`PF00314`	Thaumatin	Domain	35	245	4e-83	278.9	Thaumatin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938868.1
AATATATCATGTGATATGTAATCAGGCTTCAATTTTCTAAATTATTCAATCTTATTTAACTCACAGCAGATTCAATGTGTATATACATATATATGGTTTGAGTGAGACCGAAACTTTTTATTTTCTATCATCTCTCCTCTCTCTCTAAGTTGATGGGCTTGATTGAAAACAACAAATTACACCCAATTAAACATCCATATTAGTTTAGTCTACATCCGTAAACATCTCAAATTTCAATAAACATTCAGTGTTGTTAATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011098
ATGTTTATGTACTCAACCTCTTCTTCTGGCTATGCGGTTTACATCACCCTCATTTTTCTCCTCTTGCCCAAAGCTACTTCAGCTACTACATTCACCGTCGTAAACCGGTGCGACTACACAGTCTGGCCCGGTATTCTATCCAATGCCGGTAGCTCCGGTTTAGGCACGACCGGTTTCCAACTCACACCCCACGCCACCCAATCCTTCCAAGCTCCACCGGGATGGTCCGGCCGCTTCTGGGCTCGAACCGGCTGCTCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794851.1
MFMYSTSSSGYAVYITLIFLLLPKATSATTFTVVNRCDYTVWPGILSNAGSSGLGTTGFQLTPHATQSFQAPPGWSGRFWARTGCSFDPISGQGSCTTGDCGSNQIECNGAGAAPPATLAEFTIGSGTQDFYDVSLVDGYNLPMIVEAVGGSGGCGATGCVSDLNRVCPNELRAGDGQACKSACEAFGNPEYCCSGAYGSPATCRPSVYSEMFKNACPRSYSYAYDDATSTFTCTAADYKITFCPSRTSQKSSMDSTSSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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