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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004177`

染色体: Chr02 坐标: 64059365-64061916 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004177`
名称	SmilChr02G004177
描述	thaumatin-like protein 1b
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64059365 - 64061916 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011099`
GeneID	`131011099`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011099`
原始查询	`SmilChr02G004177`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thaumatin-like protein 1b
产物	thaumatin-like protein 1b
Arabidopsis	`AT1G75800` (AT1G75800) Pathosis-related thaumatin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843913] identity=59.1; qcov=0.788; evalue=1.5e-129; confidence=high
Rice	`Os03g0244200` - identity=56.6; qcov=0.68; evalue=1.69e-97; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00314 (Thaumatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011099

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057794852.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057794852.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057794852.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794852.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794852.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64059958`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B122
`Chr2:64059958`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B122
`Chr2:64060790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B69,C25
`Chr2:64060907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr2:64061195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr2:64061253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr2:64061264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr2:64061267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr2:64061291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C28
`Chr2:64061319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B69,C1,C25
`Chr2:64061375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C48,D11
`Chr2:64061656`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B21,B34,B87,C19,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794852.1

410 aa

205

410

Thaumatin

PF00314 Thaumatin 128-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794852.1`	Pfam	`PF00314`	Thaumatin	Domain	128	343	5.1e-84	281.8	Thaumatin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938869.1
CACACACGAAATGTTGTGCAAATTGCAAGCGCAACGCTATCTATGGCTTTTCATTTATACTAAAAAACATATGCAACACACACGAAATGTTGTGCAAATTGCAAGCGCAACGCTATGGCTTTTCAACCAACGATGGCACACGGAATTGGAAATACACAAATCATTATTCATTAATAGCCTATATATACCTCTCCACCACCCCATCCCCCAGAAACTCCTCTCTCTCTCTCTCCATCCTCTGTTTCCTCTTCTCCTCTTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011099
ATGTTGTGCAAATTGCAAGCGCAACGCTATCTATGGCTTTTCATTTATACTAAAAAACATATGCAACACACACGAAATGTTGTGCAAATTGCAAGCGCAACGCTATGGCTTTTCAACCAACGATGGCACACGGAATTGGAAATACACAAATCATTATTCATTAATAGCCTATATATACCTCTCCACCACCCCATCCCCCAGAAACTCCTCTCTCTCTCTCTCCATCCTCTGTTTCCTCTTCTCCTCTTAACACATTTATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794852.1
MLCKLQAQRYLWLFIYTKKHMQHTRNVVQIASATLWLFNQRWHTELEIHKSLFINSLYIPLHHPIPQKLLSLSLHPLFPLLLLTHLSSIHNNSRITIMGKLCFHILFLILSNSFIAEVYSTATFTFVNKCQFTVWPGILSNAGISPLSTTGFVLQTGESRIINAPSSWGGRFWGRTHCSEDPTGKFSCLTGDCGSGKLECAGGGAAPPATLAEFTLDGDAGKDFYDLSLVDGYNLPMMVAPQGGSGTNCTKAECVADLNS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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