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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004194`

染色体: Chr02 坐标: 64280116-64286842 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004194`
名称	SmilChr02G004194
描述	protein FREE1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64280116 - 64286842 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011114`
GeneID	`131011114`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011114`
原始查询	`SmilChr02G004194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FREE1
产物	protein FREE1
Arabidopsis	`AT1G20110` (AT1G20110) RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838600] identity=55.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0724100` - identity=63.5; qcov=0.722; evalue=1.38e-161; confidence=high
GO	GO:0000813 (ESCRT I complex); GO:0031902 (late endosome membrane); GO:0036258 (multivesicular body assembly); GO:0043130 (ubiquitin binding); GO:0046872 (metal ion binding); GO:0070676 (intralumenal vesicle formation)
KEGG	-
Pfam	PF01363 (FYVE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011114

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794877.1`
2	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057794877.1`
3	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.40000	`XP_057794877.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057794877.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057794877.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64280529`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B4
`Chr2:64280529`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B4
`Chr2:64280538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B15,B58,B65,C57
`Chr2:64280756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B19,B28
`Chr2:64280757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B19,B28
`Chr2:64280765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B17,B90,B92,C79
`Chr2:64282158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B103,B122,B135
`Chr2:64283164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B17,B90,B92,C79
`Chr2:64283428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:64283705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B32,B91
`Chr2:64284412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,C3,C4,D1
`Chr2:64286348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794877.1

554 aa

277

554

FYVE

PF01363 FYVE 403-467 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794877.1`	Pfam	`PF01363`	FYVE	Domain	403	467	1.8e-19	70.3	FYVE zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938894.1
CCTCTAAAGCGCTTTATACTTTAGAAACGCATCACTCTTTGATTGCTGACAAAACACTCTTTTCCTCTCTCTCTGCAATTATCTATCATCACCGCCCACACAAAAGTCAAATCAAAATCATCGCCGGAGTTTTCCTTCCTCACAATGCACAACGCCGACTACTCCTCCGTCCCTTACTACCACCAACAAAACTTCCCACAAACTCACACTCCAAATCCCAACCCAATCGATCCTCTTTACCCTGCCCCGCCCCCGTCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011114
ATGCACAACGCCGACTACTCCTCCGTCCCTTACTACCACCAACAAAACTTCCCACAAACTCACACTCCAAATCCCAACCCAATCGATCCTCTTTACCCTGCCCCGCCCCCGTCCTACGCCTCCGCCCCGCCCTTCTCCGCCAACACTTACACCCCTCCTCCGCCGCCTCCCTCCACCGACTACTCAACCTACCAACATAATTACCCTTCCTTGCCCCAAACTCCAGATCCTCCCCCCGCCGCCACCTCCTATTTGCAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794877.1
MHNADYSSVPYYHQQNFPQTHTPNPNPIDPLYPAPPPSYASAPPFSANTYTPPPPPPSTDYSTYQHNYPSLPQTPDPPPAATSYLQPQSPYSFPQFEAHGSYQPPSHSQLPSYYDHPTPNYASNPNHNPVSPNSRYPSIHPPAQYSQPTTNPYEPQYDNHDGNLSRSRSDLGTEIYSKRAESGYGSDSPYGNNEGVYAYRGSSEPYGARGTTPNSSTWSGFDDFGRPIGYSSSSSSGKERPKSSSLKVVRAVPKADAQQD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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