Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004197`

染色体: Chr02 坐标: 64303365-64305466 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004197`
名称	SmilChr02G004197
描述	proline-rich receptor-like protein kinase PERK10
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64303365 - 64305466 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011117`
GeneID	`131011117`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011117`
原始查询	`SmilChr02G004197`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proline-rich receptor-like protein kinase PERK10
产物	proline-rich receptor-like protein kinase PERK10
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011117

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057794879.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057794879.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794879.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794879.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794879.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64304601`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B133,B140,B45,B62,C1,C19,C45,C60
`Chr2:64304625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B45,C78
`Chr2:64304632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B91,C57
`Chr2:64304643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B76,B98
`Chr2:64304649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B125
`Chr2:64304672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B73
`Chr2:64304677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B66
`Chr2:64304938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B4,B58,C12,C31
`Chr2:64304941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr2:64304943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr2:64305223`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B94
`Chr2:64305223`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096738.1
TTCTGTATGGCTGACATGGCAATATGCATCCACATCACTTATTTTATTTTTAAAAATATAAAATCTAATATTTCTCTACCCCACTTCCCAAACCCTAAAACCAATTCCCCTTCTCCCATCTCTCACATCCGGTTCTCCCCTCCCCCGCCGCCGCAATCTACCCCACCGCGCCCCGCCCCTCCCACCGCTGCGATCTGCTTCGCCGGACCACCCCGCTCCCTTCCACCGCCGCGATCTGCCCCCTCCTATTCCGGTCCCCT...

XR_009096739.1
AAAACCAATTCCCCTTCTCCCATCTCTCACATCCGGTTCTCCCCTCCCCCGCCGCCGCAATCTACCCCACCGCGCCCCGCCCCTCCCACCGCTGCGATCTGCTTCGCCGGACCACCCCGCTCCCTTCCACCGCCGCGATCTGCCCCCTCCTATGTCCACACCGGTTCTTTCTCTCCCAAAATTCTCAAATCCTAATTTCACAGACTCTCATCTCCCGCATCGATTCGCTGCAGTCCGGTCCCCTGAGGCGCGACAAGACC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131011117
ATGGCTGACATGGCAATATGCATCCACATCACTTATTTTATTTTTAAAAATATAAAATCTAATATTTCTCTACCCCACTTCCCAAACCCTAAAACCAATTCCCCTTCTCCCATCTCTCACATCCGGTTCTCCCCTCCCCCGCCGCCGCAATCTACCCCACCGCGCCCCGCCCCTCCCACCGCTGCGATCTGCTTCGCCGGACCACCCCGCTCCCTTCCACCGCCGCGATCTGCCCCCTCCTATTCCGGTCCCCTGAGGCG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057794879.1
MADMAICIHITYFIFKNIKSNISLPHFPNPKTNSPSPISHIRFSPPPPPQSTPPRPAPPTAAICFAGPPRSLPPPRSAPSYSGPLRRDKTPPHRLQPPSRRPDNRDQSSPPVARFDSLQSGPLGRDKTPPHRLQPPSRRPARRDQSSPSVVRQSFNLASPTRHCPCAVVGDSSVSTNKVATPGSHK

XP_057794880.1
MADMAICIHITYFIFKNIKSNISLPHFPNPKTNSPSPISHIRFSPPPPPQSTPPRPAPPTAAICFAGPPRSLPPPRSAPSYSGPLRRDKTPPHRLQPPSRRPDNRDQSSPPVARFDSLQSGPLGRDKTPPHRLQPPSRRPARRDQSSPSVVRQSFNLASPTRHCPCAVVGDSSVSTNKVATPGSHK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器