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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004198`

染色体: Chr02 坐标: 64307046-64308875 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004198`
名称	SmilChr02G004198
描述	GDSL esterase/lipase EXL3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64307046 - 64308875 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011115`
GeneID	`131011115`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011115`
原始查询	`SmilChr02G004198`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase EXL3-like
产物	GDSL esterase/lipase EXL3-like
Arabidopsis	`AT1G75880` (AT1G75880) SGNH hydrolase-type esterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843921] identity=50.6; qcov=0.958; evalue=2.33e-121; confidence=high
Rice	`Os10g0438600` (OsGELP107) - identity=49.5; qcov=0.894; evalue=1.11e-116; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0016298 (lipase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011115

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057794878.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057794878.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794878.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794878.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794878.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64307219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C45
`Chr2:64307226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr2:64307331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C82,C85
`Chr2:64307589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,D4
`Chr2:64307633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C45
`Chr2:64307882`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C31
`Chr2:64307882`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C31
`Chr2:64307923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:64307963`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C79
`Chr2:64307963`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C79
`Chr2:64307965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr2:64307995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794878.1

359 aa

180

359

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 34-344 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794878.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	34	344	8.1e-34	118.3	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938895.1
CCGGGCATGTAACAAATGCTTATAAGAGGCTTGTTAGGTGTTAGACGAATATGATTTATGCATTTTAAGGGAAATATTTAGAAATGCAGGCGTGGAAACAAATTCCTTTTTTGATTGTCCTAATAGTGGGAGTGGGAGTTGGGGCAGCCAGAAAACTACCAGGAAACCTGAGTGTTCCGGCAGTTGTGATATTTGGAGATTCCATCGTTGATACAGGCAACAATAATTTCTACACCACCATTGCTAAATGCAACTTTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011115
ATGCAGGCGTGGAAACAAATTCCTTTTTTGATTGTCCTAATAGTGGGAGTGGGAGTTGGGGCAGCCAGAAAACTACCAGGAAACCTGAGTGTTCCGGCAGTTGTGATATTTGGAGATTCCATCGTTGATACAGGCAACAATAATTTCTACACCACCATTGCTAAATGCAACTTTCCCCCTTATGGCCAAGATTTCATGGGCGGGAACCCCACCGGCCGATTTTCCAACGGCAAAGTTCCTTCCGATCTTCTTGTGGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794878.1
MQAWKQIPFLIVLIVGVGVGAARKLPGNLSVPAVVIFGDSIVDTGNNNFYTTIAKCNFPPYGQDFMGGNPTGRFSNGKVPSDLLVEELGIKPLLPPYLDPSLSDEDLLTGVNFAAGAAGWDPITANLSAVKSLADQLEMFKGYIEKVKKIGGEQTLSKLLNESMVAVVTGSNDISNTYFITPFRRLHYDVPSYVELLVSYASSFVLDLYGLGVRRIGVTSLPPVGCLPSQRTLRGGLERKCVDEYNEVAELFNHKLSAQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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