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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004206`

染色体: Chr02 坐标: 64320541-64323975 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004206`
名称	SmilChr02G004206
描述	protein MID1-COMPLEMENTING ACTIVITY 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64320541 - 64323975 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011122`
GeneID	`131011122`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011122`
原始查询	`SmilChr02G004206`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MID1-COMPLEMENTING ACTIVITY 1-like
产物	protein MID1-COMPLEMENTING ACTIVITY 1-like
Arabidopsis	`AT4G35920` (MCA1) PLAC8 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829747] identity=62.6; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0157300` (OsMCA1) - identity=61; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0007166 (cell surface receptor signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF04749 (PLAC8); PF19584 (MCAfunc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011122

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057794886.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794886.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794886.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794886.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794886.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64320955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:64321108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:64321177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:64322292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B140,C12
`Chr2:64322823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:64323108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr2:64323122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B140,C12
`Chr2:64323275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B140,B62,C45
`Chr2:64323332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B17,B90,B92
`Chr2:64323527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794886.1

404 aa

202

404

MCAfunc

PLAC8

PF19584 MCAfunc 24-164 aa PF04749 PLAC8 285-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794886.1`	Pfam	`PF19584`	MCAfunc	Domain	24	164	1.8e-79	265.1	MCAfunc domain
`XP_057794886.1`	Pfam	`PF04749`	PLAC8	Family	285	382	5.2e-20	73.0	PLAC8 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938903.1
TTATACTCCACTAGATAGCAAATAAACATTCTTACTAAATAATGCACCTGATATTATTTAACAAGTACGGAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACCATTTTCTCCCTTTCCTACAACTGTTGTAATACCCATGCGTGAGTTGAAAATAGTAAAAAGTAGAGCTGCCAGTTTCCCATGGCACCACTGCCTCTCACTCTCATCTCCATTTTCTCCTCAAAATCCAGAAATCTTTGAGACTCTTTTCTTCTTACATTTTGAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011122
ATGTCGGCGTGGGATCACTTCGGCGAGGCCGCGAACATCATACAGCTGACGGGGCTGAACGGGGTGGCGTTGGTGGGGCTGATAGTGAAGGCGGCGAACAGGGCGCGAATGCACAAGAAGAATTGCAAGGAATTCGCGCAGCACGTGAAGCTGATTGGAAATCTGCTGGAGCAGCTCAAGATTTCGGAGCTGAAGAGGTACCCGGAGACGCGTGAGCCATTGGAGCAGCTGGAGGATGCACTGCGGCGGGCTTATCTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794886.1
MSAWDHFGEAANIIQLTGLNGVALVGLIVKAANRARMHKKNCKEFAQHVKLIGNLLEQLKISELKRYPETREPLEQLEDALRRAYLLVNSCQERSYLYLMAMGWNIVYQFRRAQEEIDRYLRIIPLIALLDNTRVKERIEEIQKDQREYTLDEDDRKVQVAISENDMIVLKKSISCSYPNLPFDKALQKEHEKLEAELHHSQSSMDVSHCHVIERLLEVTESAAGSVAEKNSSHKVSEMSVTDKDHFDSEEDSRKFDTSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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