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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004208`

染色体: Chr02 坐标: 64342311-64345585 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004208`
名称	SmilChr02G004208
描述	CO(2)-response secreted protease-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64342311 - 64345585 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011124`
GeneID	`131011124`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011124`
原始查询	`SmilChr02G004208`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CO(2)-response secreted protease-like
产物	CO(2)-response secreted protease-like
Arabidopsis	`AT1G20160` (ATSBT5.2) Subtilisin-like serine endopeptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838606] identity=57.1; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0278950` (OsSub1) - identity=48.5; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF02225 (PA); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011124

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057794888.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057794888.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057794888.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794888.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794888.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64342485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B34,B87,C19,C36
`Chr2:64342498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr2:64342510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B103,B127,B54
`Chr2:64342591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B140,C12
`Chr2:64342651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B140,C12
`Chr2:64342653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C45
`Chr2:64342663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B103,B127,B54
`Chr2:64342723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:64343061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:64343529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:64343532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:64343629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794888.1

762 aa

381

762

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 32-102 aa PF00082 Peptidase_S8 129-583 aa PF02225 PA 387-460 aa PF17766 fn3_6 662-758 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794888.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	32	102	3.7e-15	57.1	Peptidase inhibitor I9
`XP_057794888.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	129	583	2.4e-44	152.5	Subtilase family
`XP_057794888.1`	Pfam	`PF02225`	PA	Domain	387	460	3.8e-07	30.9	PA domain
`XP_057794888.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	662	758	9.2e-29	100.3	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938905.1
ACAAAACTGTTGGTCGAATCCACCAGCATCAACGCCAACCATTTATGGGGGTGGCCGCGACGCACTTTGTGTGGATGTGGAACACCTTCATTCACTCCAAGAAAATATTTATTAGAATATGTTGGAGCTGGAGCATGGGGTGTCAACACACGCATCAATCCATTACGACTCTTTCCCACTTCTGACTAGTGATCCGCACTATATATAGAGGGCGTGTGGATCTTCAACCTTGTGCTTTCATCATGAGACTTTATAGCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011124
ATGAGACTTTATAGCTTCTGCTTTGGCGTCGCTCTGTTTTGGGCGGCGTCGTTTCTTCTTGTGGAGAGTAGTGATGCACAGAGGAATAATGGAGTCTATATCGTCTACATGGGAGCCTCGCCTCCCACGCCTCATCATTCTCAGATTCTCACCTCTTTGTTAACAAGAAAGAGGAAGTCCGTGATACAAACCTACAGCAACGGCTTCTCGGGTTTCGCGGCTCGTTTAACAGAGCAAGAAGCGAAATCAATAGCTGAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794888.1
MRLYSFCFGVALFWAASFLLVESSDAQRNNGVYIVYMGASPPTPHHSQILTSLLTRKRKSVIQTYSNGFSGFAARLTEQEAKSIAEREGVISVFPDPLLQLHTTRSWDFLKYQTDLKIDSAPTSSSSPGDDTIVGILDTGIWPESESFIDTEMGPIPSRWKGKCMEGQNFTSSNCNKKIIGARYYGDDDEDEESGTSPSGTPRDASGHGTHVSSTVAGMAVSGASYYGLAAGNAAGGSPRSRIAMYRVCLASGGCLGSAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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