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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004217`

染色体: Chr02 坐标: 64397570-64400119 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004217`
名称	SmilChr02G004217
描述	uncharacterized SmilChr02G004217
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64397570 - 64400119 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011135`
GeneID	`131011135`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011135`
原始查询	`SmilChr02G004217`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836104]; symbol=AT5G59830; hit=AT5G59830; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836104]; symbol=AT5G59830; hit=AT5G59830; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G59830` (AT5G59830) DNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836104] identity=46.2; qcov=0.661; evalue=8.43e-53; confidence=high
Rice	`Os03g0278700` - identity=41.3; qcov=0.402; evalue=8.27e-21; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF16135 (TDBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011135

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794898.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794898.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794898.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794898.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794898.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64397945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C83
`Chr2:64397962`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B60,B79
`Chr2:64397962`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B60,B79
`Chr2:64398008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B112,B133
`Chr2:64398060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,B87,C13,D8
`Chr2:64398070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr2:64398081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:64398084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B130,C29
`Chr2:64398522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr2:64399011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B45,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794898.1

301 aa

150

301

TDBD

PF16135 TDBD 206-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794898.1`	Pfam	`PF16135`	TDBD	Domain	206	260	6.3e-13	49.2	Tify domain binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938915.1
GTAATGAATTTGATATAACAATAATGAATTTCATGTTTTGTTCAGTTTAAAGACTACCCAAATCGATCGTTCGATTTTCAGATTACTCGCAGATACAATACATGCAAACAGAAAACGCACACAGCCCTAACACGCACAACACTCTCCGCCGCTGCGCCACTCGTCAGTCCACCCCATCTGCCGCGCCGCCCGCAGCCGCCGCCTGCGCCACCACCTCCTTCGTCCATCGTCCCAGATTTGAGTGGCCATGCCGGCGTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011135
ATGCCGGCGTATGTGACAAAAAAATGTATGTCTAATGTGGAAATAGATGGCTCAACGCGAAAGAAAAGAGTTATTATTGGTGATCAGTTTCAGAATGACCCTGTTGCTTCATCAATTTTATATACTATGAGAGATCCCGTGAAAGGAAGTAATTGTGGTGGGTTGAAACGAATGAAGTTGAATGATGTTGAAGTTGAGCACCTCTTAGAAATGTACGAAGACGAAGATGAGGTAGAGATGAGGCCAAATACGTCTATATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794898.1
MPAYVTKKCMSNVEIDGSTRKKRVIIGDQFQNDPVASSILYTMRDPVKGSNCGGLKRMKLNDVEVEHLLEMYEDEDEVEMRPNTSISVGHPHMDGGHTALNKEPSEPAHSQRYKDVMGYLLKPASSYTLLYEPHLVPTSKTPYKKKGKCKSTQQNVQKSSPQKTPTKKEAQISSFPRNVRTLTVTGMLDGAHVQYLSASKEKELRGVIKGPSYLCGCKSCNYSKEVNAYEFESHAGCKTSHPNNHIHLENGKTLHFVVQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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