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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004223`

染色体: Chr02 坐标: 64440179-64441027 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004223`
名称	SmilChr02G004223
描述	extensin-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64440179 - 64441027 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009886`
GeneID	`131009886`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009886`
原始查询	`SmilChr02G004223`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	extensin-like
产物	extensin-like
Arabidopsis	`AT5G66100` (LARP1b) winged-helix DNA-binding transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836742] identity=42; qcov=0.317; evalue=1.67e-13; confidence=low
Rice	`Os03g0156500` - identity=38; qcov=0.495; evalue=1.4e-13; confidence=low
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF05383 (La)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009886

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793271.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057793271.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793271.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793271.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793271.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64440223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C16
`Chr2:64440248`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B107,B140,B45,C12
`Chr2:64440248`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B107,B140,B45,C12
`Chr2:64440251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B85,C50,C73,D1
`Chr2:64440252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B14,B92
`Chr2:64440351`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B126,C47,C69
`Chr2:64440351`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B126,C47,C69
`Chr2:64440451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr2:64440501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:64440504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:64440588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B9,C11,C47
`Chr2:64440623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793271.1

218 aa

109

218

PF05383 La 160-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793271.1`	Pfam	`PF05383`	La	Domain	160	209	9.9e-14	51.7	La domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937288.1
ATGAAATCGTCAGCTGCAAGATCAATGCCTAATGATCGACGTCGGGTGGCGCCACCACCACCACCGCCACCGCCACAGCCAGTTTTCTTCCCTTATCCGATGCTACCTTATAACCATCCATACGCGTACACGCCGCCGCCTGTATCTTGGTCGTTTGTTCGTCCACAACCACCTATACCCTCTTGGGACAACCTTACTTACGTTTATACTCAAACATTGCCTTCATTATCTTCGTTTGTTTCTCCACCACCACCACCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009886
ATGAAATCGTCAGCTGCAAGATCAATGCCTAATGATCGACGTCGGGTGGCGCCACCACCACCACCGCCACCGCCACAGCCAGTTTTCTTCCCTTATCCGATGCTACCTTATAACCATCCATACGCGTACACGCCGCCGCCTGTATCTTGGTCGTTTGTTCGTCCACAACCACCTATACCCTCTTGGGACAACCTTACTTACGTTTATACTCAAACATTGCCTTCATTATCTTCGTTTGTTTCTCCACCACCACCACCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793271.1
MKSSAARSMPNDRRRVAPPPPPPPPQPVFFPYPMLPYNHPYAYTPPPVSWSFVRPQPPIPSWDNLTYVYTQTLPSLSSFVSPPPPPTPPSLPFWNNTQTLHPPSFPTPTPAPPFPLAYTTPPLMHPPSFPTPTPSAPPLPLRPPSNSFPPKKEEDLSHKILKQIEYYFCDNNLAKDLHLKDQMDIDNGWVSIEIKEMTDDIKLILDSLKHSDTIEVEV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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