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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004234`

染色体: Chr02 坐标: 64519840-64521118 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004234`
名称	SmilChr02G004234
描述	uncharacterized protein At1g76070-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64519840 - 64521118 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012978`
GeneID	`131012978`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012978`
原始查询	`SmilChr02G004234`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843939]; symbol=AT1G76070; hit=AT1G76070; species=arabidopsis; confidence=low
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843939]; symbol=AT1G76070; hit=AT1G76070; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G76070` (AT1G76070) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843939] identity=32.6; qcov=1.1; evalue=7.35e-24; confidence=low
Rice	`Os09g0542900` - identity=42.1; qcov=0.314; evalue=2.58e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30939 (At1g76070)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012978

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796950.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796950.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057796950.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796950.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796950.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64520525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr2:64520576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B69,B98
`Chr2:64520618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C45
`Chr2:64520621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:64520676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr2:64520719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:64520804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:64520815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:64520822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:64520940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796950.1

242 aa

121

242

At1g76070

PF30939 At1g76070 1-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796950.1`	Pfam	`PF30939`	At1g76070	Family	1	240	2e-69	235.0	Syringolide-induced protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940967.1
CTGCATTTAATTTATATGCATGATTACATTAATGTATGCTAATCAATCGTCGACTCCTCTACTTATTTAGCCCGGAGTTTTGGACCTTTGAATAAAGAACGTTAACAGTGACAACTACCCAATGAAAGCTGTATTATTTAATGCTAATTAATAGGCGACAGTTGTTTTGCTCACTCCTATTTTCTCATTTGACCAATACCACCATTTTCTCTAAAATTTGGTCAATTTTGCATATCTTGATCCTCTCCCTTGTTCTATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012978
ATGGAAAAGCAATCATCTAAGTCGAAGAACAAAATACTGAGGTTTCTACCGAAAGCAGCTAAAGCATCATTTTCATTCCAAAACCCTTCCTTAAGCCCGGGCCGAGATAAACGGGCTAATGGAAGTTCGCAGAAGCTCAAATCCCATCTATACCGGGCTTTCTCCGGCCCGATCATTTCTATGATTCCAGCTGAAGCCCGAGAGGAGTCCACGAGTTTCGAAACGCAAGAGCCAACTTCGCCCAAGATCTCATGCATGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796950.1
MEKQSSKSKNKILRFLPKAAKASFSFQNPSLSPGRDKRANGSSQKLKSHLYRAFSGPIISMIPAEAREESTSFETQEPTSPKISCMGQIKHKKTICKLHQHASLPTEFGPVLHSQPERISKTLLPGPAAELKKKPAGIKKNFGGRRKSDDSINRGKPPLPDRAPCLSQMMRFASSRDTFASYDWATADGAGEDWGSYSDGDEDAVVPMLGGGGIVLEPRREINLWKRRTMPQLKPLQLTTLC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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